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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004242`

染色体: Chr08 坐标: 51878234-51881109 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004242`
名称	SmilChr08G004242
描述	uncharacterized SmilChr08G004242
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51878234 - 51881109 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998970`
GeneID	`130998970`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998970`
原始查询	`SmilChr08G004242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	decoy [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838024]; symbol=DECOY; hit=AT1G14620; species=arabidopsis; confidence=high
产物	decoy [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838024]; symbol=DECOY; hit=AT1G14620; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G14620` (DECOY) decoy [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838024] identity=62.5; qcov=0.971; evalue=3.83e-107; confidence=high
Rice	`Os06g0300600` - identity=62.5; qcov=1.02; evalue=1.84e-105; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998970

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780400.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057780400.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057780402.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780400.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51878672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:51878766`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A15,B104,B109,B124,B133,B136,B139,B21,B25,B44,B46,B50,B53,B73,B74,B78,B82,B85,B91,C11,C15,C17,C23,C24,C42,C46,C48,C61,C69,C81,D10
`Chr8:51878786`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A9,B1,B108,B11,B123,B18,B27,B49,B50,B6,B60,B69,B75,B92,B93,C19,C23,C26,C55,C58,C61,C64,C66,C67,C70,C83,D4,D9
`Chr8:51878835`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A9,B1,B108,B123,B18,B27,B49,B50,B6,B60,B69,B75,B93,C19,C23,C26,C38,C55,C58,C61,C64,C66,C67,C70,C83,D4,D9
`Chr8:51878976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B91,B95,C20
`Chr8:51879215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	B1,B108,B11,B123,B18,B27,B41,B49,B6,B69,B75,B87,B93,C23,C26,C38,C55,C61,C64,C66,C71,C83,C85,D4
`Chr8:51879711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B60
`Chr8:51880788`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	B1,B108,B11,B113,B18,B41,B49,B50,B6,B60,B69,B70,B75,B90,B92,B93,C19,C23,C55,C58,C61,C64,C66,C83,D8
`Chr8:51880789`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	B1,B108,B11,B113,B18,B41,B49,B50,B6,B60,B69,B70,B75,B90,B92,B93,C19,C23,C55,C58,C61,C64,C66,C83,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924419.1
TAAAGCAAATATATGGACATTTAGATTTTGAAAAAGTTTTCATAATTTTTTTAAAATGAAAAAAAAAAAGTTTTCATAATTAAACGAAAAGGTTGAGGAGCATCCGAAGCCGGTTGCCGATTCGGAGGAAATGCTCCGAACTGCAGCGTATTCGAGGTTACTAGCACGGCCGTTGCTGGTGGCTGAGCGTGGCCTCTGTACATCGGCGCCCAAGATCGGCGGCGCCGAGAAGATCGTTGCTGCCGTACTGTTCGAGAGGC...

XM_057924418.1
TAAAGCAAATATATGGACATTTAGATTTTGAAAAAGTTTTCATAATTTTTTTAAAATGAAAAAAAAAAAGTTTTCATAATTAAACGAAAAGGTTGAGGAGCATCCGAAGCCGGTTGCCGATTCGGAGGAAATGCTCCGAACTGCAGCGTATTCGAGGTTACTAGCACGGCCGTTGCTGGTGGCTGAGCGTGGCCTCTGTACATCGGCGCCCAAGATCGGCGGCGCCGAGAAGATCGTTGCTGCCGTACTGTTCGAGAGGC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130998970
ATGCTCCGAACTGCAGCGTATTCGAGGTTACTAGCACGGCCGTTGCTGGTGGCTGAGCGTGGCCTCTGTACATCGGCGCCCAAGATCGGCGGCGCCGAGAAGATCGTTGCTGCCGTACTGTTCGAGAGGCTTCCGGTTGTGGTGCCGAAAATCGATCCGGTCGTATATGCATTTCAGGAATTCTCGTTCCGATGGCAACAGCAGTATAGACGAGAATATCCTGATGCGTTCTTGCAAAAATCTAAGTCTAACACAAGAGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057780400.1
MLRTAAYSRLLARPLLVAERGLCTSAPKIGGAEKIVAAVLFERLPVVVPKIDPVVYAFQEFSFRWQQQYRREYPDAFLQKSKSNTRGPGKHDIDYTPAPRITEADKTNDKRSLQRALDRRLYLLLYGSSYDSNGTPVWHFPEKVYESEPTLRKCAESALESVIGDLSKTYFVGNAPMGHTVIQPAENDKVDASLKVLALSFCQPRLFVISFQFCLYMEAKTPFIKVAYFAKYVKYFVLCQRFFFKSQLIATGKLNVGKCE...

XP_057780401.1
MLRTAAYSRLLARPLLVAERGLCTSAPKIGGAEKIVAAVLFERLPVVVPKIDPVVYAFQEFSFRWQQQYRREYPDAFLQKSKSNTRGPGKHDIDYTPAPRITEADKTNDKRSLQRALDRRLYLLLYGSSYDSNGTPVWHFPEKVYESEPTLRKCAESALESVIGDLSKTYFVGNAPMGHTVIQPAENDKVDASLKVLALSFCQPRLFVISFQFCLYMEAKTPFIKVAYFAKYVKYFVLCQRFFFKSQLIATGKLNVGKCE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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