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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004243`

染色体: Chr08 坐标: 51884219-51888041 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004243`
名称	SmilChr08G004243
描述	uncharacterized SmilChr08G004243
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51884219 - 51888041 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998972`
GeneID	`130998972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998972`
原始查询	`SmilChr08G004243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825327]; symbol=AT3G61540; hit=AT3G61540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825327]; symbol=AT3G61540; hit=AT3G61540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G61540` (AT3G61540) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825327] identity=69.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0163600` - identity=78.8; qcov=0.193; evalue=5.95e-55; confidence=weak
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008233 (peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057780404.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057780404.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057780404.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780404.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780404.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51884490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B34
`Chr8:51884956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51885238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B38
`Chr8:51885241`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B38
`Chr8:51885241`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B38
`Chr8:51885412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:51885423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:51885433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:51885811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:51885880`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B78
`Chr8:51885880`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B78
`Chr8:51885899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780404.1

512 aa

256

512

Abhydrolase_1

PF00561 Abhydrolase_1 117-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780404.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	117	273	1.3e-15	58.4	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924421.1
TCTATCTCTCTCAGTCTCAAGTCAAACGTCAGTCAGTCATCACGAATCCACGAGCTATAAAACTAAAAGGATGCGAGCACTCGGGGCACCCCTATTATTGCTAGCGCCACTCCACTACTTTCGTATTTCCCCGTCTCCTCCATATTTGCGCACGCTCTCGCCATCTCCACCCCGGCCTCTGGTCAATTTTTTCTACTTCTACTCCTCAGCAAGACCGATCGCCGGAATCGTATCATCAATGGCCGCCGCCGGCGAACGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998972
ATGCGAGCACTCGGGGCACCCCTATTATTGCTAGCGCCACTCCACTACTTTCGTATTTCCCCGTCTCCTCCATATTTGCGCACGCTCTCGCCATCTCCACCCCGGCCTCTGGTCAATTTTTTCTACTTCTACTCCTCAGCAAGACCGATCGCCGGAATCGTATCATCAATGGCCGCCGCCGGCGAACGCGTCACGAGCGAGTGGTTCTCGGTGCCGGACCTCCGGCTCCGGAACCACAGATTCACCGTGCCTCTCGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780404.1
MRALGAPLLLLAPLHYFRISPSPPYLRTLSPSPPRPLVNFFYFYSSARPIAGIVSSMAAAGERVTSEWFSVPDLRLRNHRFTVPLDYSLSEPASPKISVFVREVVGVGKEELDLPFLLYLQGGPGFECMRPSEAGGWISKACEEYRVVLLDQRGTGLSTPLTTSSMSQFKSAEKLADYLKHFRADNIVRDAEFVRKRLVPDSRPWTVLGQSYGGFCAVTYLSFAPQGLKQVLLTGGIPPIGSGCTADAVYRACFDQIVKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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