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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G004255

染色体: Chr08 坐标: 52021371-52040129 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr08G004255
名称SmilChr08G004255
描述probable N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向52021371 - 52040129 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130998984
GeneID130998984
locus_tag-
NCBI 名称LOC130998984
原始查询SmilChr08G004255

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase
产物probable N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase
拟南芥AT3G58130 (AT3G58130)
N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol de-N-acetylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824982]
identity=58.37; qcov=0.996; evalue=8.35e-111; confidence=high
水稻Os04g0678800
-
identity=54.75; qcov=0.996; evalue=9.22e-95; confidence=high
GOGO:0000225 (N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006506 (GPI anchor biosynthetic process)
KEGGsmil00563 (Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF02585 (PIG-L)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130998984

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 内质网 1.00000 SmilChr08G004255.1
2 内质网膜 1.00000 SmilChr08G004255.9
3 脂滴 0.20000 SmilChr08G004255.26

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:52021628 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 7 A5,B104,B12,B135,B62,B89,C55
Chr8:52032135 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A9,B60
Chr8:52032713 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C2
Chr8:52032930 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B38,B39
Chr8:52033292 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr8:52034129 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A25,B37,B77,C38,D2
Chr8:52034461 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 35 A14,A19,A21,A5,B104,B108,B110,B114,B126,B3,B35,B4,B44,B46,B5,B54,B57,B78,B79,B98,B99,C15,C19,C2,C22,C27,C36,C37,C47,C5,C56,C73,C8,C9,D8
Chr8:52034945 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A18,B131
Chr8:52034978 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B104,C87
Chr8:52039045 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B22
Chr8:52039069 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr8:52039077 C CT 1bp_insertion frameshift_variant 6 A25,B37,B77,C38,D10,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004255.1
来源蛋白: XP_057780415.1
299 aa
N
1
150
299
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 96-207 aa
SmilChr08G004255.10
来源蛋白: XP_057780425.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.11
来源蛋白: XP_057780426.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.12
来源蛋白: XP_057780427.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.13
来源蛋白: XP_057780428.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.14
来源蛋白: XP_057780429.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.15
来源蛋白: XP_057780430.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.16
来源蛋白: XP_057780431.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.17
来源蛋白: XP_057780432.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.18
来源蛋白: XP_057780433.1
258 aa
N
1
129
258
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
SmilChr08G004255.19
来源蛋白: XP_057780434.1
238 aa
N
1
119
238
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 35-146 aa
SmilChr08G004255.2
来源蛋白: XP_057780416.1
299 aa
N
1
150
299
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 96-207 aa
SmilChr08G004255.20
来源蛋白: XP_057780435.1
238 aa
N
1
119
238
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 35-146 aa
SmilChr08G004255.21
来源蛋白: XP_057780436.1
238 aa
N
1
119
238
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 35-146 aa
SmilChr08G004255.22
来源蛋白: XP_057780437.1
238 aa
N
1
119
238
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 35-146 aa
SmilChr08G004255.23
来源蛋白: XP_057780438.1
238 aa
N
1
119
238
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 35-146 aa
SmilChr08G004255.24
来源蛋白: XP_057780439.1
238 aa
N
1
119
238
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 35-146 aa
SmilChr08G004255.25
来源蛋白: XP_057780441.1
238 aa
N
1
119
238
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 35-146 aa
SmilChr08G004255.26
来源蛋白: XP_057780442.1
231 aa
N
1
116
231
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 96-207 aa
SmilChr08G004255.3
来源蛋白: XP_057780417.1
299 aa
N
1
150
299
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 96-207 aa
SmilChr08G004255.4
来源蛋白: XP_057780418.1
299 aa
N
1
150
299
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 96-207 aa
SmilChr08G004255.5
来源蛋白: XP_057780419.1
299 aa
N
1
150
299
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 96-207 aa
SmilChr08G004255.6
来源蛋白: XP_057780420.1
297 aa
N
1
148
297
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 96-207 aa
SmilChr08G004255.7
来源蛋白: XP_057780421.1
279 aa
N
1
140
279
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 76-187 aa
SmilChr08G004255.8
来源蛋白: XP_057780422.1
277 aa
N
1
138
277
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 76-187 aa
SmilChr08G004255.9
来源蛋白: XP_057780423.1
260 aa
N
1
130
260
PIG-L
C
PF02585 PIG-L 46-168 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
SmilChr08G004255.1
XP_057780415.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 96 207 7.9e-15 56.2 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.2
XP_057780416.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 96 207 7.9e-15 56.2 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.3
XP_057780417.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 96 207 7.9e-15 56.2 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.4
XP_057780418.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 96 207 7.9e-15 56.2 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.5
XP_057780419.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 96 207 7.9e-15 56.2 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.6
XP_057780420.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 96 207 7.8e-15 56.2 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.7
XP_057780421.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 76 187 6.9e-15 56.4 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.8
XP_057780422.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 76 187 6.8e-15 56.4 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.9
XP_057780423.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.10
XP_057780425.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.11
XP_057780426.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.12
XP_057780427.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.13
XP_057780428.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.14
XP_057780429.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.15
XP_057780430.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.16
XP_057780431.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.17
XP_057780432.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.18
XP_057780433.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 46 168 2.3e-23 83.8 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.19
XP_057780434.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 35 146 5e-15 56.9 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.20
XP_057780435.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 35 146 5e-15 56.9 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.21
XP_057780436.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 35 146 5e-15 56.9 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.22
XP_057780437.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 35 146 5e-15 56.9 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.23
XP_057780438.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 35 146 5e-15 56.9 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.24
XP_057780439.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 35 146 5e-15 56.9 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.25
XP_057780441.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 35 146 5e-15 56.9 GlcNAc-PI de-N-acetylase
SmilChr08G004255.26
XP_057780442.1		 Pfam PF02585 PIG-L Family 96 207 4.4e-15 57.0 GlcNAc-PI de-N-acetylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

26 records

下载 cDNA FASTA
XM_057924438.1
TTTCTCCCGTCTCTCACGATTCTTCTCTGCCCCACCGCCGCAATCTGCACCACCGCGCACCCCACCCCTCCCACCGCCGGGATCTGCTTCGTCGGACCACCTGCTCCCTTCCCCCGCCGCGATCTGCCCCCTCCCATCTCCACACCGATTCTTTCTCCCCCAAAATTCCCAAATCCTAATTTCACAGACCCTCCATCTCTCGCTTCGATTCGCCACAGTCGCGCCGCCCCGTCCGTCGCGACCAGAGCAGTCCGCCAGTT...
XM_057924433.1
TTTCTCCCGTCTCTCACGATTCTTCTCTGCCCCACCGCCGCAATCTGCACCACCGCGCACCCCACCCCTCCCACCGCCGGGATCTGCTTCGTCGGACCACCTGCTCCCTTCCCCCGCCGCGATCTGCCCCCTCCCATCTCCACACCGATTCTTTCTCCCCCAAAATTCCCAAATCCTAATTTCACAGACCCTCCATCTCTCGCTTCGATTCGCCACAGTCGCGCCGCCCCGTCCGTCGCGACCAGAGCAGTCCGCCAGTT...

CDS

26 records

下载 CDS FASTA
SmilChr08G004255.7 (XP_057780421.1)
ATGTTTTCTCATAGAAGAGAGTCTCGGTCCTCGATCCCTTTCATAGGTTACAGCAGAAAAGGTAAAAACTTGTGGGCATCTCAATATACGGTGCAGATCACTGCCTTAAGAATCGAACATGGCATGGATAGCATTAATCTCATCAGTGCTAGTGCTCTGGTTTGCTTCTCTCTGCAAAGTTTTTCTGGAATCTCTGTCCGCCTCAAAAGCATCATTCTTAAACGATGGTTCTTTGCTCCTGTGATTAATTACCTGACTTC...
SmilChr08G004255.1 (XP_057780415.1)
ATGAAAAGAAAAAGAAATTTGAGAAAACTAATGGCTGTCGGAGAAGTCTGCAAGACTGCAATTGCCATTGAAACAACAGATCCACCCGCCACCACGACCCACCTTCTCTCTCTCCACTCACGGTGGCCCGACGAACTCCACCGCCTCAATACCGTAGGCTCGGCTCTTCGAATCGAACATGGCATGGATAGCATTAATCTCATCAGTGCTAGTGCTCTGGTTTGCTTCTCTCTGCAAAGTTTTTCTGGAATCTCTGTCCG...

Protein

26 records

下载 Protein FASTA
SmilChr08G004255.1 (XP_057780415.1)
MKRKRNLRKLMAVGEVCKTAIAIETTDPPATTTHLLSLHSRWPDELHRLNTVGSALRIEHGMDSINLISASALVCFSLQSFSGISVRLKSIILKRWFFAPVINYLTSRHHNVHILCMSTGNADGMGSIRKEELYLASVVLKIPTQQVKILDHPDLQDGFGKVWNWNLLASIIDDETRTHSIDVIIAFDDYGISGHCNHCDVHQGVRKLLHDASGRHLEAWEIVSPNIVRKYIGPVDIWLSILFSRLTKDRPSYCLLNLDL...
SmilChr08G004255.2 (XP_057780416.1)
MKRKRNLRKLMAVGEVCKTAIAIETTDPPATTTHLLSLHSRWPDELHRLNTVGSALRIEHGMDSINLISASALVCFSLQSFSGISVRLKSIILKRWFFAPVINYLTSRHHNVHILCMSTGNADGMGSIRKEELYLASVVLKIPTQQVKILDHPDLQDGFGKVWNWNLLASIIDDETRTHSIDVIIAFDDYGISGHCNHCDVHQGVRKLLHDASGRHLEAWEIVSPNIVRKYIGPVDIWLSILFSRLTKDRPSYCLLNLDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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