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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004263`

染色体: Chr08 坐标: 52103025-52104251 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004263`
名称	SmilChr08G004263
描述	uncharacterized SmilChr08G004263
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52103025 - 52104251 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998650`
GeneID	`130998650`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998650`
原始查询	`SmilChr08G004263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=21.2; qcov=0.559; evalue=3.91e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998650

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780048.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057780048.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057780048.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780048.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52103038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr8:52103116`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B133,C23,C3
`Chr8:52103116`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B133,C23,C3
`Chr8:52103141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B36,B87,C15
`Chr8:52103143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,A22
`Chr8:52103148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B21,C26
`Chr8:52103160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B21,B98,C26
`Chr8:52103161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr8:52103192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C21
`Chr8:52103288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B73
`Chr8:52103300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C20
`Chr8:52103312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780048.1

345 aa

172

345

DUF8566

PF29561 DUF8566 1-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780048.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	1	177	1.3e-42	146.7	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924065.1
CCCCGTTTTCCCTAGTTTACATACGAGAACAACACCATCCTCTTTCTGTGCGTACTTATCTAGACTAAGTCAGTCTCAAGTGGATTCTGTTATATCTATGGGTTTTGGACACTTGCTGGAAATGAGAGTAAGATTTCTGCCAACACAGATGGCATATTGGTTGATGGAGAATTTTGACTACAAAACTAGTGAATTGTTGATTGATGACAATGTGAAAATTAAAGTAACTGAAGATGATGTTTGTAGAGTTTTTGGTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998650
ATGGGTTTTGGACACTTGCTGGAAATGAGAGTAAGATTTCTGCCAACACAGATGGCATATTGGTTGATGGAGAATTTTGACTACAAAACTAGTGAATTGTTGATTGATGACAATGTGAAAATTAAAGTAACTGAAGATGATGTTTGTAGAGTTTTTGGTTTTCCTAAGGGTGGTGAAGAGATCAACAGGTTCCTCTATTCGGCTTGTAATGCTTTGAGTATGCAGTGGGTGTCTTTGTTCAATGTGCGACATCGTGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780048.1
MGFGHLLEMRVRFLPTQMAYWLMENFDYKTSELLIDDNVKIKVTEDDVCRVFGFPKGGEEINRFLYSACNALSMQWVSLFNVRHRDNIKIKAVLDKMLGEVDGGPWFKRHFLIAMQFSLIESYPNGTVHPFVMRCLEDLNVVRKWNWAGYMLKALIQHAQSWADNGKKIFCGPILFLVLVYVDRMHMEGSNVPRTIPICVNWSGSELLQRQKLEVDKKYFGSGSLRGPIPLPAIEQLEPANVGRNVAVSFEQSPESLLRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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