当前解析结果
SmilChr08G004268| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004268 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004268 |
| 描述 | uncharacterized protein At2g34160-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 52146457 - 52148648 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998651 |
|---|---|
| GeneID | 130998651 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998651 |
| 原始查询 | SmilChr08G004268 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817977]; symbol=AT2G34160; hit=AT2G34160; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817977]; symbol=AT2G34160; hit=AT2G34160; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G34160 (AT2G34160)Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817977] identity=73.6; qcov=0.853; evalue=9.5e-43; confidence=medium |
| Rice | Os06g0602600- identity=80.5; qcov=0.755; evalue=9.73e-42; confidence=medium |
| GO | GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01918 (Alba); PF12328 (Rpp20) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998651 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057780049.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057780049.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057780049.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780049.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780049.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057780049.1PF01918
Alba 13-55 aa
PF12328
Rpp20 16-66 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057780049.1 |
Pfam | PF01918 |
Alba | Domain | 13 | 55 | 3.4e-09 | 37.0 | Alba |
XP_057780049.1 |
Pfam | PF12328 |
Rpp20 | Family | 16 | 66 | 7.3e-06 | 26.6 | Rpp20 subunit of nuclear RNase MRP and P |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。