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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G004281

染色体: Chr08 坐标: 52399696-52401002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr08G004281
名称SmilChr08G004281
描述pentatricopeptide repeat-containing protein At1g80150, mitochondrial-like
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向52399696 - 52401002 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130999014
GeneID130999014
locus_tag-
NCBI 名称LOC130999014
原始查询SmilChr08G004281

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述pentatricopeptide repeat-containing protein At1g80150, mitochondrial-like
产物pentatricopeptide repeat-containing protein At1g80150%2C mitochondrial-like
拟南芥AT1G80150 (AT1G80150)
Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844355]
identity=57.32; qcov=1.0; evalue=8.32e-158; confidence=high
水稻Os08g0499800
-
identity=47.31; qcov=0.953; evalue=9.01e-127; confidence=high
GOGO:0005515 (protein binding)
KEGG-
PfamPF01535 (PPR); PF12854 (PPR_1); PF13041 (PPR_2); PF13812 (PPR_3); PF23276 (TPR_24)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130999014

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 线粒体 1.00000 SmilChr08G004281.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:52399717 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B118
Chr8:52399746 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B4,C73,D8
Chr8:52399754 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B108,B46,C15,C19,C47
Chr8:52399828 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B119,B60
Chr8:52399846 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B36
Chr8:52399957 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C47
Chr8:52400019 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C42
Chr8:52400121 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A2,A7,B121,C7,C78
Chr8:52400171 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B65
Chr8:52400188 AC A 1bp_deletion frameshift_variant 1 B30
Chr8:52400188 AC A 1bp_deletion CDS_variant 1 B30
Chr8:52400317 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004281.1
来源蛋白: XP_057780460.1
408 aa
N
1
204
408
PPR_3
PPR_1
PPR_2
PPR
PPR_3
PPR
TPR_24
PPR_1
PPR_3
PPR
C
PF13812 PPR_3 175-226 aa PF12854 PPR_1 177-205 aa PF13041 PPR_2 181-226 aa PF01535 PPR 183-212 aa PF13812 PPR_3 208-263 aa PF01535 PPR 218-248 aa PF23276 TPR_24 281-378 aa PF12854 PPR_1 287-311 aa PF13812 PPR_3 289-335 aa PF01535 PPR 291-320 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF13812 PPR_3 Repeat 175 226 1.3e-15 57.9 Pentatricopeptide repeat domain
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF12854 PPR_1 Repeat 177 205 1.7e-30 105.2 PPR repeat
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF13041 PPR_2 Repeat 181 226 7.4e-33 113.1 PPR repeat family
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF01535 PPR Repeat 183 212 1.4e-18 66.5 PPR repeat
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF13812 PPR_3 Repeat 208 263 1.3e-15 57.9 Pentatricopeptide repeat domain
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF01535 PPR Repeat 218 248 1.4e-18 66.5 PPR repeat
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF23276 TPR_24 Repeat 281 378 2.5e-09 37.9 Pentatricopeptide repeat-containing protein
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF12854 PPR_1 Repeat 287 311 1.7e-30 105.2 PPR repeat
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF13812 PPR_3 Repeat 289 335 1.3e-15 57.9 Pentatricopeptide repeat domain
SmilChr08G004281.1
XP_057780460.1		 Pfam PF01535 PPR Repeat 291 320 1.4e-18 66.5 PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057924477.1
TTTGCGGAGATTTATTGATAAAATCTATGATTTTGGCCGGTGGGTATGCATGAAAATTAGGGCTTTTCTAGAACATGCTCACTCTGCGACTGATTCGCAGGTTTGGCGCCGTACATCGTAATCTGGTCATCGCAGCTGTTTCTTCATCCGTTAATAAAGTTATCTCCGCCAGCAGTAGTGCTGGAAAACCTAGTTCAGTAGATGAGCCTGCATTGGTTAAGCTAAAGAAGGAAAGGGACCCTGAGAAACTGTTCAATTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
SmilChr08G004281.1 (XP_057780460.1)
ATGCTCACTCTGCGACTGATTCGCAGGTTTGGCGCCGTACATCGTAATCTGGTCATCGCAGCTGTTTCTTCATCCGTTAATAAAGTTATCTCCGCCAGCAGTAGTGCTGGAAAACCTAGTTCAGTAGATGAGCCTGCATTGGTTAAGCTAAAGAAGGAAAGGGACCCTGAGAAACTGTTCAATTTATTTAAGGCCAATGCCACAATTAAGCTTGTTGTTGAGAACCGATTTGTCTTTGAGGACACAGTCTCTAGGTTAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
SmilChr08G004281.1 (XP_057780460.1)
MLTLRLIRRFGAVHRNLVIAAVSSSVNKVISASSSAGKPSSVDEPALVKLKKERDPEKLFNLFKANATIKLVVENRFVFEDTVSRLAGAGRLDYIENLLEHQQTLPQGRREGFIIRIIMLYERARMTKHVVNTFCDMHLYGCVRTVKLFNAALKVLTESRDLQAINWFLNDVPARFGIVLDAYSFNIVIKGLCEMGILDKAFLVMAGMGKWGLAPDVFTYTLLIEASYKSNWPEIANGLWSRMVLKGCLPNIATFNVRIQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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