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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004286`

染色体: Chr08 坐标: 52556604-52557877 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004286`
名称	SmilChr08G004286
描述	uncharacterized SmilChr08G004286
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52556604 - 52557877 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998656`
GeneID	`130998656`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998656`
原始查询	`SmilChr08G004286`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.7; qcov=0.641; evalue=1.62e-18; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=30.5; qcov=1; evalue=9.39e-48; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005507 (copper ion binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998656

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780053.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780053.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780053.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780053.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780053.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52556928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C77
`Chr8:52556988`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B126,B17,B86,C17,C78
`Chr8:52556988`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B126,B17,B86,C17,C78
`Chr8:52556998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B19,B87,C22,C51
`Chr8:52557051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:52557069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:52557079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr8:52557136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A21,B76,C2
`Chr8:52557152`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr8:52557152`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr8:52557191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:52557226`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780053.1

382 aa

191

382

SWIM

PF04434 SWIM 123-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780053.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	123	152	4.3e-11	42.8	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924070.1
ATGGAGGAGATGAAAGCTGAGAGTCAGGAAGCACACACAGATTTTATGAACAGGGAATACCACAGGTTTTGTAGATGCTTTATCTCTACACATTGTCTATCTGATATGGTTGATAATAATGTCTCTGAGACATTTAATGGCTATATAGTGAAAGCTAGGGCTAAGCACATAATCACCATGTTAGAAGACATTAGAGTTGCTTTAAGGGGGAGACAGTACAAAAAGCTGGGGTTGGTGACTGATAGTACTGAAAAAATATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998656
ATGGAGGAGATGAAAGCTGAGAGTCAGGAAGCACACACAGATTTTATGAACAGGGAATACCACAGGTTTTGTAGATGCTTTATCTCTACACATTGTCTATCTGATATGGTTGATAATAATGTCTCTGAGACATTTAATGGCTATATAGTGAAAGCTAGGGCTAAGCACATAATCACCATGTTAGAAGACATTAGAGTTGCTTTAAGGGGGAGACAGTACAAAAAGCTGGGGTTGGTGACTGATAGTACTGAAAAAATATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780053.1
MEEMKAESQEAHTDFMNREYHRFCRCFISTHCLSDMVDNNVSETFNGYIVKARAKHIITMLEDIRVALRGRQYKKLGLVTDSTEKICPNIRKKLDKLRYDARMCQAYPGLGGKFEVSCYDDRFVVQLGEKHCSCRQWDISGIPCKHAIAALHFMKEEPTEYVHECYFVEKYLKAYAYGLEPINGEKMWPKGVGYPVQPPLIRAMPGRPKKKRRRDVDERDPNNNTRLKRIGIRMTCQNCLQVGHNARSCKNEKVDREEGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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