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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004293`

染色体: Chr08 坐标: 52596643-52603980 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004293`
名称	SmilChr08G004293
描述	uncharacterized SmilChr08G004293
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52596643 - 52603980 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999023`
GeneID	`130999023`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999023`
原始查询	`SmilChr08G004293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chorismate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828103]; symbol=AT4G01290; hit=AT4G01290; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	chorismate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828103]; symbol=AT4G01290; hit=AT4G01290; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G01290` (AT4G01290) chorismate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828103] identity=35.9; qcov=1.07; evalue=1.46e-143; confidence=medium
Rice	`Os06g0105900` - identity=32.3; qcov=1.07; evalue=1.42e-112; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999023

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780476.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057780476.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057780476.1`
4	P-body	P-body	0.80000	`XP_057780476.1`
5	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057780476.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52597431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B94,B98,C80,D11
`Chr8:52597573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C1
`Chr8:52597788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:52597992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr8:52598158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B94,B98,C80,D11
`Chr8:52598244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,C2,C44,D9
`Chr8:52598314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:52598469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:52600065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B94,B98,C80
`Chr8:52600788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:52601545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924493.1
AGCGTTTTTTTTCCATCTTGTTTCTCAAAATTCAAATTTATAGCGTCTCTCTCCCATTTTCCATTTCACAAACAAAAAATATATATAGATATACGCGCACACACGTATAGATACAAATATATATATATGTATGTGTATGGTTTTATATGCGTAAGTTGAAATACCTATATGTGCGTGATGTATCTCTCTCTGCGAAGAGATGGTTGATCAGATAATAGGAAAACAAATTTGCTAGGATTTTAAACCCTAACTTTTCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999023
ATGAGCTCACAAGATGAAGATAGAAGGTCCTTGGACGAGGGTTCTGAAACTCATGAAGATGTTTCAACGAAGCCAAAAATATCCTATTCAAGAGAGTTTCTACTGTCGATCAGCACTTCGGATATCTGCAAGAAGTTGCCGAGCGGGTTTGATGAATCACTGTCAAGTGAAATGGAAGAAGCACTGTTGAAATTACCTGATCGAACAAGAATTCCTGGGAGCTTGCCATACCAAGGTTTCAGAAGGAATGAGTATTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780476.1
MSSQDEDRRSLDEGSETHEDVSTKPKISYSREFLLSISTSDICKKLPSGFDESLSSEMEEALLKLPDRTRIPGSLPYQGFRRNEYSSSPPTRGDTSTYSRGIYGKWDSRSSARSDRDSDSQSDKDSDSGKRFGNQSRRPWQTPEHDGLLGSGSFPRPSGYSAGISAAKVRPNEQNQLSRSSEPYHPPRPYKAVPHSRKDTDAFNDETFGSIESTNEDRAEQERRRRASFEMMRKEQHKALQEKQINSGKSKVGDVLSLCE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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