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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004295`

染色体: Chr08 坐标: 52637659-52639281 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004295`
名称	SmilChr08G004295
描述	uncharacterized SmilChr08G004295
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52637659 - 52639281 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998659`
GeneID	`130998659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998659`
原始查询	`SmilChr08G004295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200]; symbol=AT2G36290; hit=AT2G36290; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200]; symbol=AT2G36290; hit=AT2G36290; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G36290` (AT2G36290) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200] identity=60.9; qcov=0.858; evalue=1.85e-141; confidence=high
Rice	`Os02g0532300` (P0605D08.22-2) - identity=57.2; qcov=0.855; evalue=2.54e-132; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780057.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057780057.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780057.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780057.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52637733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B73,C72,C86
`Chr8:52637795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,C28,C70
`Chr8:52637802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr8:52637812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:52637843`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B72,C86
`Chr8:52637843`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B72,C86
`Chr8:52637908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B73,C72,C86
`Chr8:52637976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B72,B73,C23,C72
`Chr8:52637981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B37,C47,C54,C79
`Chr8:52638198`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A18,B52,B72,B73,C72,C86
`Chr8:52638209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B108,C23,D4
`Chr8:52638247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B54,B86,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780057.1

358 aa

179

358

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF12146 Hydrolase_4 78-197 aa PF00561 Abhydrolase_1 81-342 aa PF12697 Abhydrolase_6 81-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780057.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	78	197	1.1e-08	35.4	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057780057.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	81	342	2.9e-18	67.1	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057780057.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	81	346	9.9e-14	53.2	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924074.1
ATGATGAATGCCTTGTTGATTGGTTCAAGATTACCCCAGAACATGTGGGGAGAAGCTGTATTAACGGCTAATTATATCTTGAACAAGATTCCTCTCAAAGGGAAAGATGTAACCCCCTATGAGCTGTGGAAAGGAAGAAAACCTTCAAATAAACTTACAGCACCAAGAATACAGCTCAAGGATGGGAGGTACTTGGCTTACAAAGAATCTGGTGTGCCAAAGGATGTAGCAAAACACAAAATATTGTTTGTCCATGGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998659
ATGATGAATGCCTTGTTGATTGGTTCAAGATTACCCCAGAACATGTGGGGAGAAGCTGTATTAACGGCTAATTATATCTTGAACAAGATTCCTCTCAAAGGGAAAGATGTAACCCCCTATGAGCTGTGGAAAGGAAGAAAACCTTCAAATAAACTTACAGCACCAAGAATACAGCTCAAGGATGGGAGGTACTTGGCTTACAAAGAATCTGGTGTGCCAAAGGATGTAGCAAAACACAAAATATTGTTTGTCCATGGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780057.1
MMNALLIGSRLPQNMWGEAVLTANYILNKIPLKGKDVTPYELWKGRKPSNKLTAPRIQLKDGRYLAYKESGVPKDVAKHKILFVHGFANCRLHVAALNANLSPDMVESRGIYIVSFDRPGYGESSPHPNRTVKSLAFDIEELADQLGLGPKFYVVGYSMGGQVVWSCLKYIPHRLAGAALLTPVVNYWWPGFPSHLSRRAYNKQFIQDQWALRVAHYMPWLTYWWNTQKLFSSSSVIAGHPDIFTNPDKQLFPKIVSLVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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