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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004302`

染色体: Chr08 坐标: 52700948-52703033 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004302`
名称	SmilChr08G004302
描述	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52700948 - 52703033 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999031`
GeneID	`130999031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999031`
原始查询	`SmilChr08G004302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
产物	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
Arabidopsis	`AT5G49690` (AT5G49690) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835032] identity=38.4; qcov=0.967; evalue=4.37e-106; confidence=medium
Rice	`Os03g0804900` - identity=37.6; qcov=1.01; evalue=3.07e-103; confidence=medium
GO	GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00201 (UDPGT); PF26168 (Glyco_transf_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780484.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780484.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780484.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780484.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780484.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52701209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:52701384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B29,B85
`Chr8:52701514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B61,C17,C36,C51
`Chr8:52701779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:52701810`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B113,B134,C18,C25,C34,C57,C79
`Chr8:52701953`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A21,A5,B23,B42,B43,B55,B93,C41,C45,C58,C77,C85
`Chr8:52702010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D4
`Chr8:52702053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:52702244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:52702366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B61,C26,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780484.1

480 aa

240

480

Glyco_transf_N

UDPGT

PF26168 Glyco_transf_N 13-192 aa PF00201 UDPGT 288-435 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780484.1`	Pfam	`PF26168`	Glyco_transf_N	Domain	13	192	3.4e-08	34.4	Glycosyltransferase, N-terminal domain
`XP_057780484.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	288	435	7.9e-12	45.5	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924501.1
GAATCGAATTTAGTATTCAAAATCAAATCGAATATTAAAATATTTTCATAAATATGAATCAAATATGGCGTTATTCGCTTCGATTAGATTACAATCCTATTCCCGAGCTAAAACACAAAATCCAAATTACAGAAGTGACATTAAATTTTTACCCCCAACTCCCACATGATTGAAATGCTCGATTTAAGTCCATCAAATGGCCGAGAGATATATGCACTTACTAAGAAATTGTTTGAAATAGTTTATTTGGGGTAATTAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999031
ATGAATAAAGGTGGAAGAAAAATGAGTGAAGAAAATGAGGTTCATGTTGTGATGCTGCCATGGCTGGCATTTGGTCACATGATCCCATACTTGGATCTCTCTATTGCCTTAGCCAAATTTGGCATTCATGTCTCCTTCATCTCTACTCCCCAAAACATTGCAAGACTCCCCAAAATCCCACCAAATCTGTCAAAATTCATCGAATTCGTGCCCCTTCCTCTCCCCAAGCTCGATTCCGATCCCCTGCCGGAGAATGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780484.1
MNKGGRKMSEENEVHVVMLPWLAFGHMIPYLDLSIALAKFGIHVSFISTPQNIARLPKIPPNLSKFIEFVPLPLPKLDSDPLPENAGATTDIPADRMDDLKKACDLLQEPISNFIAKKLPNWIVVDFFYHKVLDIAEELNIPVIFYLIVTAAAAVFCWKPEFLAGEGQRQTRTSPQDMTVPPNWVDFPSQVVCRNHEATAMHNLLYGASSSGIQDGARMTRIAQGCQAFALRTCLELEADYLKLYSKITGKPVIPMGCLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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