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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004304`

染色体: Chr08 坐标: 52736015-52738744 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004304`
名称	SmilChr08G004304
描述	uncharacterized SmilChr08G004304
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52736015 - 52738744 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999044`
GeneID	`130999044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999044`
原始查询	`SmilChr08G004304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=32.3; qcov=0.961; evalue=2.73e-38; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=43.8; qcov=0.911; evalue=1.04e-66; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780497.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057780497.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057780497.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780497.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52736295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B56,B96
`Chr8:52736295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:52736298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A24,C13
`Chr8:52736298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C13
`Chr8:52736310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B22,B4,B44,B60
`Chr8:52736310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B22,B4,B44,B60
`Chr8:52736313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr8:52736314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B132,B136,B4,C13
`Chr8:52736328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C47,C85
`Chr8:52736364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B4,B77,C13
`Chr8:52736374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B44,B60,D11,D5
`Chr8:52736381`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B4,B44,B60,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780497.1

325 aa

162

325

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF26138 DUF8040 1-71 aa PF01609 DDE_Tnp_1 98-260 aa PF13359 DDE_Tnp_4 109-263 aa PF04827 Plant_tran 206-266 aa

XP_057780498.1

258 aa

129

258

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF01609 DDE_Tnp_1 31-193 aa PF13359 DDE_Tnp_4 42-196 aa PF04827 Plant_tran 140-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780497.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	1	71	5.7e-19	68.5	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057780497.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	98	260	2.4e-07	31.4	Transposase DDE domain
`XP_057780497.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	109	263	6.3e-22	78.6	DDE superfamily endonuclease
`XP_057780497.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	206	266	8e-05	23.1	Plant transposon protein
`XP_057780498.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	31	193	1.6e-07	32.0	Transposase DDE domain
`XP_057780498.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	42	196	3.9e-22	79.3	DDE superfamily endonuclease
`XP_057780498.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	140	199	7.5e-05	23.1	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924515.1
CATCAGCCCGACGACCCGCATGAATAATGTTGTTTCGCCTCGTTCAATTAACTAGCGTTGGGCACCGGTTTACATTAATCTAGGAGGGCTAAAAAATTCAAATTTCATTAATGCCCTCCGAAAATCGATTTTAAAGATTGGGATTTGGGAACAACAAAATCTGCCATTTTCTTCATCTGCTTTGCCGTGAAAGAATGCTCCGTCGAACTGGTAAAATGTTGAAGGCTCTTGTATCTTTTGCTGCTACGACAATTCTTTTC...

XM_057924514.1
AGTTGTGGCTTGGATGATTGAGGAAGTTATGCGTCAATTTTACAACTAACTAGTCGTTATTATTGAAGTAATCATTAGGCTGAAATCCCGTAAGAGAAAACGTGGCTGTGAGTCTCAGCCTTACAGCTATATAGCTCGGATACCCGACCAAGTAAAGCACTTAAATCGATTAACTAATGTTAGTGATGTAGATTGTATACTCAATCTAAGGATGGACTGCAACACATTCGGTCGATTATGTAACTTGTTAAAGCAACTAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999044
ATGCTCCGTCGAACTGGTAAAATGTTGAAGGCTCTTGTATCTTTTGCTGCTACGACAATTCTTTTCCACCCCAAGGCACGACAAAAGGGATGCCTCGGTGCATTAGACGACACATATATTAGTGTGTTGGTGCCCAATATTGACAAGGCCAGGTATAGAACACGTAAGGGGCAGATTGCGACCAACATGCTAGGAGTATGTGATCGCAATATGAAGTTTGTGTATGCACTGCCGGGTTGGGAGGGCTCAGCTGCTGATTC...

LOC130999044
ATGGACTGCAACACATTCGGTCGATTATGTAACTTGTTAAAGCAACTAGGTTCTTTGGATGACGGTACATATGTAAGTGTTGAAGAACAAGTGGTGATGTTCTTGTCAATCTTAGCACATCATAAGAAGAATAGGATTGTCCGTTTTGATTTTTGGAGATCGGGACAAACAATATCACATTACGTGCATACTGTCTTGAATGCCATTTTGAAGATCCATGTACTCCTATTGGTGAAGCCACAACCCGTTTCCGAAGAATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780497.1
MDCNTFGRLCNLLKQLGSLDDGTYVSVEEQVVMFLSILAHHKKNRIVRFDFWRSGQTISHYVHTVLNAILKIHVLLLVKPQPVSEECNDSRWKWFKGCLGALDDTYISVLVPNIDKARYRTRKGQIATNMLGVCDRNMKFVYALPGWEGSAADSRVLRDAVNRRHGFRVPRGNYYLVDCGYANSEGFLAPYKGVRYHLKEWGPTNSRPQNAEELFNLQHAKAQNVIERAFGIIKMRWAALRSTTYYPIKVQVRLIMACVL...

XP_057780498.1
MLRRTGKMLKALVSFAATTILFHPKARQKGCLGALDDTYISVLVPNIDKARYRTRKGQIATNMLGVCDRNMKFVYALPGWEGSAADSRVLRDAVNRRHGFRVPRGNYYLVDCGYANSEGFLAPYKGVRYHLKEWGPTNSRPQNAEELFNLQHAKAQNVIERAFGIIKMRWAALRSTTYYPIKVQVRLIMACVLLENFIRSNMAVDPIEQQYDLLLQDLENTNDEQEDFVDTIESSQWWNADRDVLAQTMWQQYLHAMN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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