当前解析结果
SmilChr08G004306| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004306 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004306 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004306 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 52751025 - 52752191 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998661 |
|---|---|
| GeneID | 130998661 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998661 |
| 原始查询 | SmilChr08G004306 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=27.2; qcov=0.683; evalue=1.21e-24; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998661 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057780058.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057780058.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057780058.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780058.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780058.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:52751101 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C16 |
Chr8:52751107 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C16 |
Chr8:52751137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B105,B98,D9 |
Chr8:52751143 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,C58 |
Chr8:52751145 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B22,C7 |
Chr8:52751158 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B30,B55,C37 |
Chr8:52751166 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,A18,B131,B15,B60 |
Chr8:52751176 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr8:52751194 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,D10 |
Chr8:52751276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr8:52751292 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,C85 |
Chr8:52751352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A5,B122,B133,B27,B3,B75,C16,C21,C42,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。