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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004321`

染色体: Chr08 坐标: 52902551-52905396 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004321`
名称	SmilChr08G004321
描述	protein BPS1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52902551 - 52905396 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999043`
GeneID	`130999043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999043`
原始查询	`SmilChr08G004321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BPS1, chloroplastic-like
产物	protein BPS1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G46080` (BPS2) BPS1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819216] identity=56.9; qcov=0.963; evalue=2.43e-139; confidence=high
Rice	`Os10g0513300` - identity=46.8; qcov=0.839; evalue=9.62e-87; confidence=high
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1); PF05633 (ROH1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780495.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057780495.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057780495.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780495.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780495.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52902855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:52902863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:52902872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:52903024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr8:52903044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:52903113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:52903120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:52903136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:52903387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B37,B68,C40
`Chr8:52903762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B61,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780495.1

354 aa

177

354

ROH1-like

BPS1

PF05633 ROH1-like 36-139 aa PF03087 BPS1 93-306 aa

XP_057780496.1

354 aa

177

354

ROH1-like

BPS1

PF05633 ROH1-like 36-139 aa PF03087 BPS1 93-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780495.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	36	139	1.1e-12	48.4	Protein ROH1-like
`XP_057780495.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	93	306	1.7e-08	35.2	Protein BPS1
`XP_057780496.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	36	139	1.1e-12	48.4	Protein ROH1-like
`XP_057780496.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	93	306	1.7e-08	35.2	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924512.1
GAAATATTTTGGGTCAAAAGAGACTGCAATTTGGAGTATGGAAAAAGAGAAAATAACCCCAATCCGTACGAGAAAAGTATTTAATAAAAAATAAAAAAACTAAAAGCCTTCGATTTCCCAAACACAGACGCCTTAATCAACGGCCAGATTTCGCCGGCCCAGTCTCCTACATGCGCCCCCACCCTACATAAAATACACCGGCAATATACGCTTTCCAATTAGATTCCGCCACGTGTGCCAACAACTCCCACTCCCACAAT...

XM_057924513.1
ATTCAGTTTCTACAACCCTACATTTTGCGAAGACTTTGTGCGAAGCTTTACCAATTCTCTACGCGTCTTCGGGTACTTTTTCAGGTACAGGAATTCTCTCTCTTCCCGAGATCGATTTCATGGCATATGTGTGTGTGTTTGTGGACTTGGTTTGCGATAATCGGTGCTGATTTGGGCCGTTGACCGGCTTATTTGTTAGTGTAATAGAATGAGCCGCCCACAAGAACCACACAGACCTTTCCTCCCCTTTGGAAATCCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999043
ATGAGCCGCCCACAAGAACCACACAGACCTTTCCTCCCCTTTGGAAATCCTTTCCGTAGGATGTCACCAAAGGGTTCATACCAGTCCCCTAAACTTCTTGCTTTGTTGACTACCTTTGAGGAGACATTGCAGGGTAGAATTAAAAATCTTAGGCCAGTAGGTAGGGATGATGTCCTGCGCTTATCGTGGATGAGGTTTGCGATGGACACACTCTGTGAAATTCATACTGACGTGAAAACTCTAATTACGGCTCTTGAACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780495.1
MSRPQEPHRPFLPFGNPFRRMSPKGSYQSPKLLALLTTFEETLQGRIKNLRPVGRDDVLRLSWMRFAMDTLCEIHTDVKTLITALELPVCDWEDKWIDVYLDDSVKLLDICIAFSSEISQLKQGHLFLQCVLRNFGGAPTKQFERARSSLDGWKQHVAKKNPRFDNCFCAMDVLAEKLDLPKIKNSAKGKVLMQAMYGVKVVSLLVCSIFAAAFSGSTKKLLDLQVPETFSWAAAFSELQAFVNTEIRSLHSSGRTTILK...

XP_057780496.1
MSRPQEPHRPFLPFGNPFRRMSPKGSYQSPKLLALLTTFEETLQGRIKNLRPVGRDDVLRLSWMRFAMDTLCEIHTDVKTLITALELPVCDWEDKWIDVYLDDSVKLLDICIAFSSEISQLKQGHLFLQCVLRNFGGAPTKQFERARSSLDGWKQHVAKKNPRFDNCFCAMDVLAEKLDLPKIKNSAKGKVLMQAMYGVKVVSLLVCSIFAAAFSGSTKKLLDLQVPETFSWAAAFSELQAFVNTEIRSLHSSGRTTILK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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