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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G004348

染色体: Chr08 坐标: 53132869-53144638 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr08G004348
名称SmilChr08G004348
描述mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向53132869 - 53144638 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130999074
GeneID130999074
locus_tag-
NCBI 名称LOC130999074
原始查询SmilChr08G004348

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
产物mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
拟南芥AT4G00450 (CCT)
RNA polymerase II transcription mediator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827954]
identity=53.11; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
水稻Os07g0648266 (OsMed12_1)
-
identity=45.86; qcov=0.479; evalue=0.0; confidence=medium
GOGO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex)
KEGG-
PfamPF09497 (Med12)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130999074

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 细胞核 1.00000 SmilChr08G004348.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:53133442 GC G 1bp_deletion frameshift_variant 1 C18
Chr8:53133442 GC G 1bp_deletion CDS_variant 1 C18
Chr8:53133465 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B76
Chr8:53133514 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B104,C76,D8
Chr8:53133525 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B1
Chr8:53133532 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B123
Chr8:53133775 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A1,B111,B90,B92,C31
Chr8:53134211 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A18
Chr8:53135188 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C6
Chr8:53135562 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C32
Chr8:53135898 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A15
Chr8:53136474 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 1 C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004348.1
来源蛋白: XP_057780532.1
2222 aa
N
1
1111
2222
Med12
C
PF09497 Med12 159-219 aa
SmilChr08G004348.2
来源蛋白: XP_057780533.1
2222 aa
N
1
1111
2222
Med12
C
PF09497 Med12 159-219 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
SmilChr08G004348.1
XP_057780532.1		 Pfam PF09497 Med12 Domain 159 219 4e-19 69.5 Transcription mediator complex subunit Med12
SmilChr08G004348.2
XP_057780533.1		 Pfam PF09497 Med12 Domain 159 219 4e-19 69.5 Transcription mediator complex subunit Med12

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA
XR_009093405.1
AAGTACTAAAAACTCAGTTCCTATCTCTCTCTAAAACTTTCTCTTTCTGTATCTTGCAACCTATAGATACACCGATACATACAGATACAATAAAACAACTACGTAATCTAGAATACCCCTGAATTTGATTCCTCCAACACGATTTGAAATCCCTAATCTGGTAGTAAACCTTCTGTTATCGGCACTTGAAATCTCTCATCGTCCCCTCAATTTCCGCAATTTCTCTCTCTTCAGTTCGTGATTTAAGTTATCTGTGAAAA...
XM_057924549.1
AGTACTAAAAACTCAGTTCCTATCTCTCTCTAAAACTTTCTCTTTCTGTATCTTGCAACCTATAGATACACCGATACATACAGATACAATAAAACAACTACGTAATCTAGAATACCCCTGAATTTGATTCCTCCAACACGATTTGAAATCCCTAATCTGGTAGTAAACCTTCTGTTATCGGCACTTGAAATCTCTCATCGTCCCCTCAATTTCCGCAATTTCTCTCTCTTCAGTTCGTGATTTAAGTTATCTGTGAAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
SmilChr08G004348.1 (XP_057780532.1)
ATGCAAAGGTATCATGCTGGCAGCTGCACTAGTGCAGTCAATAACAGTGCAATTTCCGGAATACAGTCAAGGGATGCATCCCGTGCTGACCCATCAACTTTGCCTCCTAACTTCTCACTAAATTCAAGACGCTCTGCACAGCCAAACCAATACAAATTGAGGTGTGACAAGGAATCATTGAACTCCAGACTTGGGCCACCTGACTATCACCCGCAGACTCCAAATTGCCCTGAGGAGACACTTACCAGGGAGTATGTGCA...
SmilChr08G004348.2 (XP_057780533.1)
ATGCAAAGGTATCATGCTGGCAGCTGCACTAGTGCAGTCAATAACAGTGCAATTTCCGGAATACAGTCAAGGGATGCATCCCGTGCTGACCCATCAACTTTGCCTCCTAACTTCTCACTAAATTCAAGACGCTCTGCACAGCCAAACCAATACAAATTGAGGTGTGACAAGGAATCATTGAACTCCAGACTTGGGCCACCTGACTATCACCCGCAGACTCCAAATTGCCCTGAGGAGACACTTACCAGGGAGTATGTGCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
SmilChr08G004348.1 (XP_057780532.1)
MQRYHAGSCTSAVNNSAISGIQSRDASRADPSTLPPNFSLNSRRSAQPNQYKLRCDKESLNSRLGPPDYHPQTPNCPEETLTREYVQSGYRETVEGLEESREILLSQVQFFNNPTIAKCKEAIRKCHRAINESRAQKRKAGQVYGVPLSGTLLTKPGIFPEQRPCGEDFRRKWIEGLSQPHKRLRSLADHVPHGYRRKSPFEVLIRNNVPLLRATWFVKVTYLNQVRTTSSNSSSGYHDKTHVSRSEQWTKDIIEYLQCL...
SmilChr08G004348.2 (XP_057780533.1)
MQRYHAGSCTSAVNNSAISGIQSRDASRADPSTLPPNFSLNSRRSAQPNQYKLRCDKESLNSRLGPPDYHPQTPNCPEETLTREYVQSGYRETVEGLEESREILLSQVQFFNNPTIAKCKEAIRKCHRAINESRAQKRKAGQVYGVPLSGTLLTKPGIFPEQRPCGEDFRRKWIEGLSQPHKRLRSLADHVPHGYRRKSPFEVLIRNNVPLLRATWFVKVTYLNQVRTTSSNSSSGYHDKTHVSRSEQWTKDIIEYLQCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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