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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004349`

染色体: Chr08 坐标: 53157776-53163300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004349`
名称	SmilChr08G004349
描述	uncharacterized SmilChr08G004349
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53157776 - 53163300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999075`
GeneID	`130999075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999075`
原始查询	`SmilChr08G004349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GPI-anchored adhesin-like protein, putative (DUF3741) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827901]; symbol=TRM15; hit=AT4G00440; species=arabidopsis; confidence=low
产物	GPI-anchored adhesin-like protein, putative (DUF3741) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827901]; symbol=TRM15; hit=AT4G00440; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00440` (TRM15) GPI-anchored adhesin-like protein, putative (DUF3741) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827901] identity=30.6; qcov=0.965; evalue=5.54e-71; confidence=low
Rice	`Os03g0106200` - identity=27.3; qcov=1.02; evalue=1.04e-41; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12552 (DUF3741); PF14309 (DUF4378)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780534.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780534.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780534.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780534.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53158272`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A21,A22,A25,A8,B104,B107,B133,B135,B136,B24,B25,B36,B37,B38,B39,B59,B61,B62,B66,B89,B94,C10,C12,C13,C38,C55,C60,C65,C73,D4
`Chr8:53158325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C58
`Chr8:53158497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:53158732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:53158993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C1,C87
`Chr8:53159388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:53159866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C1,C87
`Chr8:53159963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:53159980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C81
`Chr8:53160057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B52,C25,C28,C5
`Chr8:53160124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B52,C25,C5
`Chr8:53160430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B24,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780534.1

961 aa

480

961

DUF3741

DUF4378

PF12552 DUF3741 206-266 aa PF14309 DUF4378 787-932 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780534.1`	Pfam	`PF12552`	DUF3741	Domain	206	266	2.2e-11	44.5	Protein of unknown function (DUF3741)
`XP_057780534.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	787	932	2e-34	120.1	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924551.1
CATTAATATTAAATGCTCTCTCTCTGTCTCTCCCGTTTATATCGCCCCATCAGCACAATTGTCTCTCTCTCCTCTCCCTGAAAAAGTGCTCTCTCTCACTCACACACACACACGCAGGCACGCACTATTACCTACACTTTCCAACCTTTCCCTTGTTTCTTTTCTTTTATTTATATCTGTGTTTACAGTCTTTAATGGCTGCCCCACACATAAGTTTTTGGTTCCAATTTCTTAATAAGTGGGTGGGTGATTTTCCCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999075
ATGGCAAAGAAATCACAGAAGCGCCTTTTGAGGCATGAAAGAGGTCAGGCAGGTTGTATGTCGGGTTTAATTAGCATATTTCACTTCCGCCATGGGAGATCCACCAAACGTTTGCTTTCAGATAGAAGCCGTGTGAACAAGCAAGTAGTCGGCGGTGAATATTCAGGCAACCAAACTGTTATACTTGATCCGACTGAAAAATGCGAAAGCATCAAGGTCGCTGAAGAAAGTAATATGTCTATGCTTGATGCTGCTAAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780534.1
MAKKSQKRLLRHERGQAGCMSGLISIFHFRHGRSTKRLLSDRSRVNKQVVGGEYSGNQTVILDPTEKCESIKVAEESNMSMLDAAKTSVKELMEEEMYNEQGSGNPKGSATGLEHSNSNNGNHLKKRQKKRSRSRIKSSDLDVTELGKSEQLRPENCNQGQEQRPLDNLDLEMIMEELAQFNQRNVNGSKNELHGDLDIPSGQTVNVVEEKLVAAVILLAEQRLNCSKHFGEDGNDCCSKEFMDALKTLSLNKGLLLKLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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