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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004356`

染色体: Chr08 坐标: 53274175-53278866 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004356`
名称	SmilChr08G004356
描述	uncharacterized SmilChr08G004356
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53274175 - 53278866 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998670`
GeneID	`130998670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998670`
原始查询	`SmilChr08G004356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.6; qcov=0.308; evalue=1.59e-41; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=32.7; qcov=0.451; evalue=1.23e-102; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780066.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780066.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780066.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780066.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780066.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53274198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:53274244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:53274256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr8:53274256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:53274257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A5,B22,B29,B37,B48,B54,B86,C41,C54,C86
`Chr8:53274364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B20,B35,C11
`Chr8:53274391`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr8:53274391`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr8:53274439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B139,C61
`Chr8:53274441`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A11,A19,B104,B121,B134,B138,B139,B30,B57,B84,C16,C26,C35,C53,C54,C61,C67,D3
`Chr8:53274445`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A11,B104,B121,B134,B138,B57,B84,C16,C26,C35,C53,C54,C67,D3
`Chr8:53274467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,C25,C54,C59,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780066.1

1484 aa

742

1484

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 755-1014 aa PF13966 zf-RVT 1290-1383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780066.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	755	1014	8.9e-35	121.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057780066.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	1290	1383	1.2e-18	68.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924083.1
ATGGTGGATAACACTGCGGGAGGTAACATTGCAAGGAAGACTGAAGACGATCTCAATAAAATCTTCAAGACATTAGCTGAAAGCTCCCAACAAAAGACAGTCCGTGGAAGGAAGGCAGAGGCTAGTGCAGTGGCACCCAGTTATGAGCTCCAAAAGCAGATGGCCGACATGAAGAGAGAGCTGCAGCAGCTGAAGATGGACAAGGTGGCAAACCCTCCTACCCACCAACCGAATGTCGAGAGATGTGGCATTTGTGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998670
ATGGTGGATAACACTGCGGGAGGTAACATTGCAAGGAAGACTGAAGACGATCTCAATAAAATCTTCAAGACATTAGCTGAAAGCTCCCAACAAAAGACAGTCCGTGGAAGGAAGGCAGAGGCTAGTGCAGTGGCACCCAGTTATGAGCTCCAAAAGCAGATGGCCGACATGAAGAGAGAGCTGCAGCAGCTGAAGATGGACAAGGTGGCAAACCCTCCTACCCACCAACCGAATGTCGAGAGATGTGGCATTTGTGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780066.1
MVDNTAGGNIARKTEDDLNKIFKTLAESSQQKTVRGRKAEASAVAPSYELQKQMADMKRELQQLKMDKVANPPTHQPNVERCGICGDFGHGANECHRMSERTYEGGVDVFAVQGLSGPTAVLSTSAAIPRATREFPAIAGPQQYQNVPQQFQKPAPPQKPSLEDTMQSFMAMTKQNMESQSATIKRLEIIVGQLTGALSQLQQQQPTGKFPIQDQQPHQAHAVAVVNEDAPITTGKWRSKIMEAIKAIQCPSEPLPPFTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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