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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004361`

染色体: Chr08 坐标: 53338578-53341145 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004361`
名称	SmilChr08G004361
描述	ATG8-interacting protein 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53338578 - 53341145 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999089`
GeneID	`130999089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999089`
原始查询	`SmilChr08G004361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATG8-interacting protein 1
产物	ATG8-interacting protein 1
Arabidopsis	`AT2G45980` (ATI1) mesoderm induction early response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819206] identity=38.6; qcov=0.918; evalue=6.48e-41; confidence=medium
Rice	`Os02g0821900` - identity=30.3; qcov=1.08; evalue=4.13e-29; confidence=low
GO	GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057780554.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057780554.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057780554.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057780554.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780554.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53338969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B16
`Chr8:53339434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B85,B9,C39
`Chr8:53339593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,D11
`Chr8:53339903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B83,C46,C86
`Chr8:53339924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:53339965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C50
`Chr8:53339971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B121,B85,B9,C39
`Chr8:53340101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924571.1
TACATTTACTTTTTATAAATAATAGTAATAATTTAAAAGTTATGGAATTTGATACTTGTCCAAGCTAACAAGACATAAAATAACAAAAAAAAAAAAAAAACGGACGAAAAAGGCTAAATACCGCCCTCTCCTATCATCATCTTCACATTTCCCGCTGCAACTCAGTTCTCGGCGGTTGCGATGTCGGATAATAACGAGGGAGAGGAGATTTCTCAGAAGGGAAATGATTGGGAAGTTGTAGCGCTCACGGAGTCTGCATA...

XM_057924572.1
AATAGTAATAATTTAAAAGTTATGGAATTTGATACTTGTCCAAGCTAACAAGACATAAAATAACAAAAAAAAAAAAAAAACGGACGAAAAAGGCTAAATACCGCCCTCTCCTATCATCATCTTCACATTTCCCGCTGCAACTCAGTTCTCGGCGGTTGCGATGTCGGATAATAACGAGGGAGAGGAGATTTCTCAGAAGGGAAATGATTGGGAAGTTGTAGCGCTCACGGAGTCTGCATATGCTGCTGCTCCTGGTCCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999089
ATGTCGGATAATAACGAGGGAGAGGAGATTTCTCAGAAGGGAAATGATTGGGAAGTTGTAGCGCTCACGGAGTCTGCATATGCTGCTGCTCCTGGTCCCAGAAACATTCTGGATAATAGTGACAACAATTTAAGCGGGGATGATGATTCTGAGACTGCTCGTGCCATGTTCATGTCCGGCCACTTTGGATTTTCGCCTAGTGCGCTTGAGAACTTTCCACTAGAACCTGAATACAAGGAGAAATATTCTGTAGAGGGCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780554.1
MSDNNEGEEISQKGNDWEVVALTESAYAAAPGPRNILDNSDNNLSGDDDSETARAMFMSGHFGFSPSALENFPLEPEYKEKYSVEGNDHDVHQVTEQQGSKSDLKQEESLNIEGLISDDFSGVTQFDEKYKSMSFYSSDLGDVTSSKLIEKEQGLYGTGKSSYVDDDAAGGVPFLADEGTGVAETFESLDDAVNSRVSNVHTHVEEDKFSEPTLPCDAWWRKRAASLYGHAKNANPYWSLVVAAAVIGLVIIGRRWQRDR...

XP_057780555.1
MSDNNEGEEISQKGNDWEVVALTESAYAAAPGPRNILDNSDNNLSGDDDSETARAMFMSGHFGFSPSALENFPLEPEYKEKYSVEGNDHDVHQVTEQQEKEQGLYGTGKSSYVDDDAAGGVPFLADEGTGVAETFESLDDAVNSRVSNVHTHVEEDKFSEPTLPCDAWWRKRAASLYGHAKNANPYWSLVVAAAVIGLVIIGRRWQRDRPQVFQLKSQLTAGDKEAHWILSPMGRLKGVNLGGQHSSYIGLSSVTQG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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