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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004371`

染色体: Chr08 坐标: 53456809-53457486 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004371`
名称	SmilChr08G004371
描述	uncharacterized SmilChr08G004371
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53456809 - 53457486 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998672`
GeneID	`130998672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998672`
原始查询	`SmilChr08G004371`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25; qcov=0.907; evalue=1.18e-09; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=32.4; qcov=1.02; evalue=1.49e-23; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780069.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780069.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780069.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780069.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780069.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53456894`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	98	A1,A13,A18,A20,A4,A8,B100,B105,B11,B113,B118,B124,B125,B126,B130,B136,B138,B139,B140,B16,B19,B21,B27,B28,B3,B30,B31,B36,B38,B39,B44,B47,B52,B59,B6,B62,B64,B72,B74,B75,B76,B77,B81,B82,B87,B89,B91,B93,B94,C10,C11,C13,C14,C16,C19,C21,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C47,C48,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C59,C6,C63,C65,C69,C7,C70,C71,C75,C79,C80,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D7
`Chr8:53456915`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	69	A1,A16,A19,A22,A23,A25,A6,B10,B108,B109,B111,B112,B114,B115,B119,B121,B122,B126,B135,B15,B20,B24,B25,B27,B31,B32,B37,B39,B43,B46,B49,B5,B50,B62,B63,B66,B68,B69,B71,B79,B80,B83,B86,B87,B89,C1,C10,C12,C2,C32,C41,C46,C49,C5,C55,C60,C64,C66,C68,C7,C78,C80,C86,D1,D2,D4,D7,D8,D9
`Chr8:53456927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B120,B61,B97,C75,D3
`Chr8:53456927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B61,B97,C75,D3
`Chr8:53456928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	191	A10,A13,A14,A15,A16,A2,A20,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B22,B23,B26,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B37,B38,B4,B40,B41,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C59,C6,C61,C63,C64,C66,C67,C70,C71,C73,C74,C76,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D5,D8,D9
`Chr8:53456933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C19,C47
`Chr8:53456983`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A11,A24,B117,B140,B22,B41,B68,B70,B75,B78,B79,B80,C2,C3,C34,C40,C48,C86
`Chr8:53456994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,C26,C65,D10
`Chr8:53457052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:53457067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B93,C21,C3
`Chr8:53457075`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C3
`Chr8:53457075`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780069.1

172 aa

172

SWIM

PF04434 SWIM 55-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780069.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	55	85	9.1e-10	38.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924086.1
ATGTCTAGGATCAGAGATAGAAAAGGCAATGTTGATTCTTGGAAAAATGATCGGTCTACTGCTAGCTTGAAGTTATTTGAACTTGCTAAATCTGAATCAATGACATGCAATGTCATTTGGAATGGTGAAGATGGTTATGAGATTGGAGAGGGTGAGGATAAGCATACTGTGTCTCTAGATAATAAGCTGTGTACATGTAGGGTATGGGAGCTAACTGGTGTCCCTTGTAGTCATGCCTTGGCTGCCATGTACTCTTCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998672
ATGTCTAGGATCAGAGATAGAAAAGGCAATGTTGATTCTTGGAAAAATGATCGGTCTACTGCTAGCTTGAAGTTATTTGAACTTGCTAAATCTGAATCAATGACATGCAATGTCATTTGGAATGGTGAAGATGGTTATGAGATTGGAGAGGGTGAGGATAAGCATACTGTGTCTCTAGATAATAAGCTGTGTACATGTAGGGTATGGGAGCTAACTGGTGTCCCTTGTAGTCATGCCTTGGCTGCCATGTACTCTTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780069.1
MSRIRDRKGNVDSWKNDRSTASLKLFELAKSESMTCNVIWNGEDGYEIGEGEDKHTVSLDNKLCTCRVWELTGVPCSHALAAMYSSGLDPLSVMSNWYHKSMFVKSYEHSIKPVLGVKFWKVREVDGIEPPPVEKKTGRPRKMRVRAPNEPKKSHKLSRRGQKQHCSICKMF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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