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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004376`

染色体: Chr08 坐标: 53522998-53525731 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004376`
名称	SmilChr08G004376
描述	calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53522998 - 53525731 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999101`
GeneID	`130999101`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999101`
原始查询	`SmilChr08G004376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 2
产物	calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 2
Arabidopsis	`AT4G00330` (CRCK2) calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828125] identity=59.1; qcov=0.984; evalue=7.23e-174; confidence=high
Rice	`Os03g0148700` (OsRLCK100) - identity=66.4; qcov=0.769; evalue=1.55e-161; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999101

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780574.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780574.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780574.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780574.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780574.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53523196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B4,C63,C84
`Chr8:53523266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr8:53523333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr8:53523382`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A24,A7,B135,B67,C60
`Chr8:53523382`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A24,A7,B135,B67,C60
`Chr8:53524159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A21,B77,C19
`Chr8:53524176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C52
`Chr8:53524908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:53524980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:53525115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780574.1

426 aa

213

426

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 138-407 aa PF00069 Pkinase 138-409 aa

XP_057780575.1

425 aa

212

425

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 137-406 aa PF00069 Pkinase 137-408 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780574.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	138	407	2e-49	169.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057780574.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	138	409	1.2e-49	169.8	Protein kinase domain
`XP_057780575.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	137	406	2e-49	169.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057780575.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	137	408	1.2e-49	169.8	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924592.1
GTTTAGTTTTCAAAAAAGTGGGCATGGATAAAAGTCAAAGTCATCGTCGCTAACACAACTTGCAATTTAATGCCAAAGCTGCCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAAACACATAATCCACTTGAAAAAACTTGTGCGACGTAGGAGCATCCCTAGCCATGAGGAGTTCTTCTCTCGGCGGCCGGCGCCGGAGCTCCGACGCCGGAACGCCTGTGAATTCCTCTCACTCGGCGAGCACATCGACCTTCTCCTCA...

XM_057924591.1
AATTTAATGCCAAAGCTGCCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAAACACATAATCCACTTGAAAAAACTTGTGCGACGTAGGAGCATCCCTAGCCATGAGGAGTTCTTCTCTCGGCGGCCGGCGCCGGAGCTCCGACGCCGGAACGCCTGTGAATTCCTCTCACTCGGCGAGCACATCGACCTTCTCCTCATCAGCCTCCACCAATACTTCTCGGAGGTCAGCCACCCCCACAACCGCCGCCACCAGGAACCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999101
ATGAGGAGTTCTTCTCTCGGCGGCCGGCGCCGGAGCTCCGACGCCGGAACGCCTGTGAATTCCTCTCACTCGGCGAGCACATCGACCTTCTCCTCATCAGCCTCCACCAATACTTCTCGGAGGTCAGCCACCCCCACAACCGCCGCCACCAGGAACCCCGTCGCCGCCGCCGCCTGCTCCATCGCGGATGCGCTGGTGGCTTGTTTCACTCCCCCCGAGCCGGAGAAAAACTTCAGCAACACTTTCAATGATTCTTCTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780574.1
MRSSSLGGRRRSSDAGTPVNSSHSASTSTFSSSASTNTSRRSATPTTAATRNPVAAAACSIADALVACFTPPEPEKNFSNTFNDSSAASSSGSRQRRNSNQSIYGSTNGSTHRREPGSMKFTFEEILKATRNFSPTLKIGQGGFGTVYKGHLEDGTIVAIKRAKKIVYDKHLGVEFQTEVRTLAKVEHQNLVRLYGFLEHEDERILVVEYVANGTLREHLDCLDGNILDFASRLEIAIDVAHAVTYLHMYTDHPIIHRDI...

XP_057780575.1
MRSSSLGGRRRSSDAGTPVNSSHSASTSTFSSSASTNTSRRSATPTTAATRNPVAAAACSIADALVACFTPPEPEKNFSNTFNDSSASSSGSRQRRNSNQSIYGSTNGSTHRREPGSMKFTFEEILKATRNFSPTLKIGQGGFGTVYKGHLEDGTIVAIKRAKKIVYDKHLGVEFQTEVRTLAKVEHQNLVRLYGFLEHEDERILVVEYVANGTLREHLDCLDGNILDFASRLEIAIDVAHAVTYLHMYTDHPIIHRDIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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