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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004380`

染色体: Chr08 坐标: 53554292-53555285 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004380`
名称	SmilChr08G004380
描述	uncharacterized SmilChr08G004380
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53554292 - 53555285 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999106`
GeneID	`130999106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999106`
原始查询	`SmilChr08G004380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=67.6; qcov=0.432; evalue=5.85e-62; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=51.7; qcov=1.01; evalue=3.83e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780585.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057780585.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057780585.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780585.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53554327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C43,C58
`Chr8:53554331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:53554340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B96,C20,D7
`Chr8:53554341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A8,C35,C36,C43,C58
`Chr8:53554341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,C35,C36,C43,C58
`Chr8:53554344`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B26,C27
`Chr8:53554344`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B26,C27
`Chr8:53554362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A2,B129,B13,B27,B42,B5,B68,B73,B76,B99,C8,C87,D3,D5,D9
`Chr8:53554376`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A2,A22,A4,B108,B115,B118,B119,B125,B129,B136,B17,B37,B41,B42,B51,B61,B62,B67,B69,B78,B79,B90,B98,C10,C14,C15,C22,C23,C29,C36,C38,C39,C41,C51,C55,C6,C63,C66,C68,C73,C81,C83
`Chr8:53554378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B2,B47,B51,C30
`Chr8:53554382`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C32,C68
`Chr8:53554382`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780585.1

322 aa

161

322

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 60-261 aa PF13359 DDE_Tnp_4 89-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780585.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	60	261	4.4e-106	353.8	Plant transposon protein
`XP_057780585.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	89	252	4.5e-14	53.1	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924602.1
TTTCGAGCAACGCATGGATTGCACAGGAAGATGGGGCTTGTCCACACTGCAAAAAATAACAGCTGCCTTTCGAATATTGGCATACGGGGTACCAGCAGATGCTACTGACGAGTACATAAATATTGGTGAGTCCACTGCAATTAAATGTGTCAAGAAATTCTGTCGTGCAATTGTGGAAATATTTTCTGATCAATATCTAAGATCTCCTAATGCTAGTGATGTTGCTAGACTACTTTATATTGGTAAACAACGTGGATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999106
ATGGATTGCACAGGAAGATGGGGCTTGTCCACACTGCAAAAAATAACAGCTGCCTTTCGAATATTGGCATACGGGGTACCAGCAGATGCTACTGACGAGTACATAAATATTGGTGAGTCCACTGCAATTAAATGTGTCAAGAAATTCTGTCGTGCAATTGTGGAAATATTTTCTGATCAATATCTAAGATCTCCTAATGCTAGTGATGTTGCTAGACTACTTTATATTGGTAAACAACGTGGATTTCCAGGAATGTTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780585.1
MDCTGRWGLSTLQKITAAFRILAYGVPADATDEYINIGESTAIKCVKKFCRAIVEIFSDQYLRSPNASDVARLLYIGKQRGFPGMLGSLDCMHWKWKNCPTGWAGSYAGRSGSPTIILEIVADYDLWIWHAFFGMPGSNNDINVLERSHLFSDLARGITPPAHYVIQGKEYNVGYYLADGIYPKWSTLVQTFHEPRSVKKKFFAMRQESCRKDVERAFEVLQSRFAIVANPARYWQKKHLDNIMKACIIMHNMIVEDERD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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