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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004383`

染色体: Chr08 坐标: 53567720-53569477 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004383`
名称	SmilChr08G004383
描述	uncharacterized SmilChr08G004383
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53567720 - 53569477 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998674`
GeneID	`130998674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998674`
原始查询	`SmilChr08G004383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=23.5; qcov=0.862; evalue=3.58e-30; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.6; qcov=0.935; evalue=4.92e-40; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780071.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780071.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780071.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780071.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780071.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53567722`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	102	A1,A10,A11,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A9,B1,B10,B101,B107,B111,B112,B114,B115,B120,B121,B122,B126,B127,B128,B131,B132,B135,B138,B14,B140,B17,B2,B20,B23,B25,B27,B28,B30,B31,B32,B33,B34,B37,B45,B46,B47,B51,B52,B53,B55,B61,B66,B67,B69,B7,B70,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B9,B97,B98,C17,C19,C23,C24,C31,C32,C35,C38,C39,C40,C42,C46,C47,C51,C58,C6,C60,C63,C68,C75,C76,C78,C8,C80,C82,C83,C86,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D8
`Chr8:53567750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B120,B97,C75,D3
`Chr8:53567791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:53567793`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A23,B128,B130,B45,C44,C56,C84
`Chr8:53567944`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B1,B140,B2
`Chr8:53567944`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B1,B140,B2
`Chr8:53567956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B61,C31
`Chr8:53567963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr8:53568151`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B114
`Chr8:53568151`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B114
`Chr8:53568162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B140,B2
`Chr8:53568201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780071.1

493 aa

246

493

MULE

PF10551 MULE 172-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780071.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	172	246	2.4e-09	38.1	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924088.1
ATGTCCAGAGTTGATGACCTGGGAAAGAATTTTTTTTACAATAGTAAAGAAGAACTGGTCCTTGCTGTTGGCTTGTGGAATATGAAGCAAGGCACTGACGCAAAAGTTGGCCGCTTAGATCAGGGACGCCTCTATTTCAAGTGCAAACACTCTGAGAAATGCAAATTGAAACCAATCAAGGCACACTCGAATGTGGTTGCAACTTATGTGGCAAAAAGAATACGCGATGATGGAGAGATCATTAAGCCGAAATCTATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998674
ATGTCCAGAGTTGATGACCTGGGAAAGAATTTTTTTTACAATAGTAAAGAAGAACTGGTCCTTGCTGTTGGCTTGTGGAATATGAAGCAAGGCACTGACGCAAAAGTTGGCCGCTTAGATCAGGGACGCCTCTATTTCAAGTGCAAACACTCTGAGAAATGCAAATTGAAACCAATCAAGGCACACTCGAATGTGGTTGCAACTTATGTGGCAAAAAGAATACGCGATGATGGAGAGATCATTAAGCCGAAATCTATTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780071.1
MSRVDDLGKNFFYNSKEELVLAVGLWNMKQGTDAKVGRLDQGRLYFKCKHSEKCKLKPIKAHSNVVATYVAKRIRDDGEIIKPKSIMAGLINEFDFRIKYDVALSARNLGLEMIYGRFDDLFILLPKYLHALQQANPGTLIDLEVDEKCRFKHLFVALRASISPFYFDLRPVIVVDGTHLKMKNNGILFIVVAKDGNEQVFPLAFGVGPIENDESWKCFLSHVREGCGQPDNLLVVSDVHVSIANAHLLNKIKGYGQAVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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