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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004392`

染色体: Chr08 坐标: 53671722-53674603 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004392`
名称	SmilChr08G004392
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53671722 - 53674603 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999114`
GeneID	`130999114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999114`
原始查询	`SmilChr08G004392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 9-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 9-like
Arabidopsis	`AT2G45850` (AT2G45850) AT hook motif DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819193] identity=38.6; qcov=1.08; evalue=3.58e-47; confidence=medium
Rice	`Os04g0589900` (OsAHP1) - identity=44.6; qcov=0.625; evalue=1.26e-40; confidence=medium
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780595.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780595.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780595.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780595.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780595.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53672807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:53672841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B77,B9,C20,C73
`Chr8:53672891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:53672896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B104,B123
`Chr8:53674253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C84
`Chr8:53674273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:53674344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B61,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780595.1

309 aa

154

309

PCC

PF03479 PCC 145-260 aa

XP_057780596.1

309 aa

154

309

PCC

PF03479 PCC 145-260 aa

XP_057780597.1

309 aa

154

309

PCC

PF03479 PCC 145-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780595.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	145	260	1.7e-22	80.4	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain
`XP_057780596.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	145	260	1.7e-22	80.4	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain
`XP_057780597.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	145	260	1.7e-22	80.4	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924612.1
ATAGTAAATATTTACGAAAATAAAGTACTCTATTTTCTGACATGGAAAGCCCGATTGCGGCAAAATATCTGTTCGCATTCTCAACAGGCATTTAGTCAGAAAAAACCAAGAAAAAGAGCACTGCATATCTTCAGATAAGAACGCTTTCAAAGTTATGTTGTGTCAAGAGTAGAAGCCCCAAAGTAAATGCATGGATCAAAGGGATGCTATGACATTAGCGGGCTCGGGTTCGTATTACATGCAGGCCGACTCTGCAGCAG...

XM_057924613.1
ATGGTGAGTTCATCCATGCCTTATTTCTTCAACTGTTTATCTCTGCCAACCCTTTTCAACACTATGGCTTATGTTCGCATTTCATTCGTCAAGTTTCAATCTTTCCTCAACTTTCTCGAAAACCATTGTGCATGTTTAGTATGTACCATGTTCTTGTAAGGCAATGGCGTTTTTTGTCTAAGAAAAATGGGTTTTGTTTCTTGAAATTCTGCTTGAGGATTGACAAGAGTGTGAGGAGAAATTGTTTCTAGAAGCTTATT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130999114
ATGGATCAAAGGGATGCTATGACATTAGCGGGCTCGGGTTCGTATTACATGCAGGCCGACTCTGCAGCAGGGCTGCAGAGCTCACCTAACATGAGCCCAATGTCGAATGCTGCTGTACACTTCCAGTCCAACACCGGTGGCAGCTTAAATGTGTCGTCGTTACCTTTAGATACTTCATCAGCAATGTCTCCTCACGGAGTTAGTGTAGGTGTAGGTGTAGGTCCACATGCTATGCAGCAAGGCGAACCTGTGCGCAGGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057780595.1
MDQRDAMTLAGSGSYYMQADSAAGLQSSPNMSPMSNAAVHFQSNTGGSLNVSSLPLDTSSAMSPHGVSVGVGVGPHAMQQGEPVRRKRGRPRKYGHDGAVSLGLSPSISSPTPMARATQKWRGRPPGAGRKQQLSPLGGSTFTGAGTMTPHIINVAVGEDIKRKVLSLLQGRRGIVILSGIGSISAANIKISNSSGSVTYEGHFDMINLSGSYINDVDGPHGPTGGLNVTFAGPDGRLIGGPVEGLLIAGSPVQVIAGSM...

XP_057780596.1
MDQRDAMTLAGSGSYYMQADSAAGLQSSPNMSPMSNAAVHFQSNTGGSLNVSSLPLDTSSAMSPHGVSVGVGVGPHAMQQGEPVRRKRGRPRKYGHDGAVSLGLSPSISSPTPMARATQKWRGRPPGAGRKQQLSPLGGSTFTGAGTMTPHIINVAVGEDIKRKVLSLLQGRRGIVILSGIGSISAANIKISNSSGSVTYEGHFDMINLSGSYINDVDGPHGPTGGLNVTFAGPDGRLIGGPVEGLLIAGSPVQVIAGSM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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