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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004393`

染色体: Chr08 坐标: 53675072-53677555 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004393`
名称	SmilChr08G004393
描述	putative ripening-related protein 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53675072 - 53677555 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999115`
GeneID	`130999115`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999115`
原始查询	`SmilChr08G004393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative ripening-related protein 1
产物	putative ripening-related protein 1
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0637000` - identity=58.5; qcov=0.458; evalue=1.22e-59; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24300 (KWL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999115

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057780598.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057780598.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780598.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780598.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53675274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr8:53675448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C2,C4
`Chr8:53675478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,C14,C63,C64,C67
`Chr8:53675484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C14,C64
`Chr8:53675508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,C41,C63,C84
`Chr8:53675522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B43
`Chr8:53675540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B45,B73,B88
`Chr8:53675606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C63,C84
`Chr8:53676896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr8:53677121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:53677206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:53677407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C33,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780598.1

347 aa

174

347

KWL1

PF24300 KWL1 23-186 aa PF24300 KWL1 188-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780598.1`	Pfam	`PF24300`	KWL1	Domain	23	186	1e-119	398.1	Kiwellin-1
`XP_057780598.1`	Pfam	`PF24300`	KWL1	Domain	188	347	1e-119	398.1	Kiwellin-1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924615.1
AAGTCACATATCTTGAGCACTTTTTTGGAGTTATTTATTGAAAATGAATCTATTTAAACACTCAAACTTCATCCCATTTCTGCATCCAAAAATCAGTGTTTCAATACTAAACTTAAAGAAAACATAGAGCCAAGATGAAGAACCTCAACAAAGTAGCCATCTTTGCTTTGCTAATCATCCTTGCTGCTCAGGCGTTGGAGGGCCGTCTTCAATCCTGCAACCCGAGTGGCAAAATCAGGGGAAAGAAACCACCTCCGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999115
ATGAAGAACCTCAACAAAGTAGCCATCTTTGCTTTGCTAATCATCCTTGCTGCTCAGGCGTTGGAGGGCCGTCTTCAATCCTGCAACCCGAGTGGCAAAATCAGGGGAAAGAAACCACCTCCGGGGCAATGCAACCAGCAAAATGACTCCGATTGCTGTAAACAAGGGAAGCTCTACACCACTTACAAATGCTCTCCCCCCATTTCTGGAAGCACGAAAGCAGTTCTCACCATCAACAGCTTCCAGAAGGGTGGAGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780598.1
MKNLNKVAIFALLIILAAQALEGRLQSCNPSGKIRGKKPPPGQCNQQNDSDCCKQGKLYTTYKCSPPISGSTKAVLTINSFQKGGDGGGPSECDNQYHSDDTPVVALSTGWYSGGSRCLNNVTISGNGRSVTAMVVDECDSTMGCDEDHDYQPPCPNNIVDASKAVWKALGVPEGDWGELDITWSDPCKPSGKIKGKKPPKDKCNKSNDSECCEEGKFYDIYKCSPSVSGRTKGFLTLNGFEKGKDGGGPSECDGHYHSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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