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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004401`

染色体: Chr08 坐标: 53701469-53704204 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004401`
名称	SmilChr08G004401
描述	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53701469 - 53704204 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999124`
GeneID	`130999124`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999124`
原始查询	`SmilChr08G004401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
产物	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
Arabidopsis	`AT3G48480` (AT3G48480) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824007] identity=46.1; qcov=0.65; evalue=3.04e-61; confidence=high
Rice	`Os11g0214001` - identity=46.5; qcov=0.543; evalue=1.73e-54; confidence=medium
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999124

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780605.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057780605.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057780605.1`
4	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057780605.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057780605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53702269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B46,C41
`Chr8:53702830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:53702918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:53702953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C87,D2
`Chr8:53703100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B46,C2,C41
`Chr8:53703150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,C63,C67,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780605.1

337 aa

168

337

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 178-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780605.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	178	308	2.6e-11	44.5	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924622.1
TAACCCGCACCCCCGATAGGATTGGCCCAAAACCCGGTGGACTGGCTTGATTGACATCCCTAATTTTTATTATAGTCACATCACATCTATTGAATGCCAAAATTGAATATAAACACACACTTCAGTAAAATGACTCTTCGATCATCGAGAACTCTGAGCCACGGCAATGTCGAAGCGAAAGCAGCCTGAATTCGCCACAGATCATTCCGACGACGTCCTTTCTGAAGAATTTGGAAGTTTGAAAAATATAAAGGGTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999124
ATGTCGAAGCGAAAGCAGCCTGAATTCGCCACAGATCATTCCGACGACGTCCTTTCTGAAGAATTTGGAAGTTTGAAAAATATAAAGGGTTGTTATCATTTACATCCAATTTATAAGTCCATCCAGCGTAGGATAGAATTCTATGATCTACTTGATAAAGATAAGATTCCTCGTTGCCGGAGGTCAATGAGGGGATTTAGGAGGAAGAAAAAAACAGCCGAGCTAGATGCTGGGAAACGGGTTGGAAGCGTTGCGAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780605.1
MSKRKQPEFATDHSDDVLSEEFGSLKNIKGCYHLHPIYKSIQRRIEFYDLLDKDKIPRCRRSMRGFRRKKKTAELDAGKRVGSVAKASSRSRDVRCKLKAETEESDCVVIYTSVCNGRVLRRPRGSTTEGQETGKLSSGKFEIHIENMWRKLSEEEKKGFTYLDSLWFSLHAKGTHKTKVLSWIKKKDIFSKKYVFVPIVQWGHWFLLIFCHFGENSEAKSERRCMLLLDSLQKAHAKQLESGIRKFVFDIFKTEKRPEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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