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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004433`

染色体: Chr08 坐标: 54025766-54027593 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004433`
名称	SmilChr08G004433
描述	elicitor-responsive protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54025766 - 54027593 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999151`
GeneID	`130999151`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999151`
原始查询	`SmilChr08G004433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elicitor-responsive protein 3-like
产物	elicitor-responsive protein 3-like
Arabidopsis	`AT1G63220` (AT1G63220) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842627] identity=48.5; qcov=1.05; evalue=9.92e-37; confidence=medium
Rice	`Os02g0640000` - identity=46.1; qcov=1.14; evalue=3.87e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999151

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780638.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780639.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780639.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780638.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54026394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C5,C86
`Chr8:54026434`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A13,B107,B125,B51,C13
`Chr8:54026434`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A13,B107,B125,B51,C13
`Chr8:54026691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B133,D5
`Chr8:54026706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:54027052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780638.1

148 aa

148

PF00168 C2 4-102 aa

XP_057780639.1

126 aa

126

PF00168 C2 25-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780638.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	4	102	4.1e-21	75.9	C2 domain
`XP_057780639.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	25	80	3.4e-13	50.4	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924656.1
TTTTGCAAAAGGGTGTGAGTAATTAAATAAAAGTTTTGTTGTTTGAAAATCAAAATAACAAAGTTTCTTTTTTAGTAGGAAGAAAACAATTTTAAGAATCATCCAACAAAGATAAAACTATCGAATTCCTCTCTCTCTCTCTCTGTATTATATCCAAATGCCGCAGGGAACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCGATGCCAATGGTTTGGAGAGCACAGATTTTTTATTTGAAGGATCGTCGCCCACGTGGAACGAGACCTTCA...

XM_057924655.1
TTTTGCAAAAGGGTGTGAGTAATTAAATAAAAGTTTTGTTGTTTGAAAATCAAAATAACAAAGTTTCTTTTTTAGTAGGAAGAAAACAATTTTAAGAATCATCCAACAAAGATAAAACTATCGAATTCCTCTCTCTCTCTCTCTGTATTATATCCAAATGCCGCAGGGAACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCGATGCCAATGGTTTGGAGAGCACAGATTTTTTATCCAGCACTGATGCTTATGCCATAATCAAATGCCAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999151
ATGCCGCAGGGAACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCGATGCCAATGGTTTGGAGAGCACAGATTTTTTATTTGAAGGATCGTCGCCCACGTGGAACGAGACCTTCATGTTTTCCATCTCTAAGGATGTTAAGGAACTGAAAATCAGGATTATGGATAAAGACACTATTGGTGCTGATGACTTTGTTGGTGAAGTGATAGTTCCTCTTGAGGCGGCGTTTGAGGCTGAAAGAGTTCCAACAACTATGTACAATGTTGTCAAGGA...

LOC130999151
ATGCCGCAGGGAACGCTTGAAGTTGTTCTTGTCGATGCCAATGGTTTGGAGAGCACAGATTTTTTATCCAGCACTGATGCTTATGCCATAATCAAATGCCAAGATCAGGAGAAAACAAGCAAAGTTGCATCAGTTGAAGGATCGTCGCCCACGTGGAACGAGACCTTCATGTTTTCCATCTCTAAGGATGTTAAGGAACTGAAAATCAGGATTATGGATAAAGACACTATTGGTGCTGATGACTTTGTTGGTGAAGTGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780638.1
MPQGTLEVVLVDANGLESTDFLSSTDAYAIIKCQDQEKTSKVASVEGSSPTWNETFMFSISKDVKELKIRIMDKDTIGADDFVGEVIVPLEAAFEAERVPTTMYNVVKDGTLCGGLNVSLKFTHQNVRSRGFSNEDLGGWKSSSSAMD

XP_057780639.1
MPQGTLEVVLVDANGLESTDFLFEGSSPTWNETFMFSISKDVKELKIRIMDKDTIGADDFVGEVIVPLEAAFEAERVPTTMYNVVKDGTLCGGLNVSLKFTHQNVRSRGFSNEDLGGWKSSSSAMD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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