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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004443`

染色体: Chr08 坐标: 54145546-54148990 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004443`
名称	SmilChr08G004443
描述	COP9 signalosome complex subunit 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54145546 - 54148990 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999166`
GeneID	`130999166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999166`
原始查询	`SmilChr08G004443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP9 signalosome complex subunit 1
产物	COP9 signalosome complex subunit 1
Arabidopsis	`AT3G61140` (FUS6) COP9 signalosome complex subunit 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825286] identity=75.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0116500` - identity=73.3; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008180 (COP9 signalosome)
KEGG	-
Pfam	PF01399 (PCI); PF10602 (RPN7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780650.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780650.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057780651.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057780651.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057780651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54145940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B52,C16
`Chr8:54145952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:54145953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B48
`Chr8:54146232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:54146274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,D3
`Chr8:54146585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:54146597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:54146748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:54146814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C67
`Chr8:54148656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780650.1

471 aa

236

471

RPN7

PCI

PF10602 RPN7 108-282 aa PF01399 PCI 321-389 aa

XP_057780651.1

445 aa

222

445

RPN7

PCI

PF10602 RPN7 108-282 aa PF01399 PCI 321-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780650.1`	Pfam	`PF10602`	RPN7	Repeat	108	282	5.6e-56	189.7	26S proteasome subunit RPN7
`XP_057780650.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	321	389	1.4e-13	51.6	PCI domain
`XP_057780651.1`	Pfam	`PF10602`	RPN7	Repeat	108	282	9.2e-56	189.0	26S proteasome subunit RPN7
`XP_057780651.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	321	400	7.8e-18	65.2	PCI domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924668.1
CACTTATTTTTGTGAGATCTTCCTTTTTAGCGATGGCACCGAAAGCCCATAAAGCAAAATAAATTATACGCGGGCCCAGATTAAGAAACGCCCATTTATCCACACGTGCGAAGCCCACATTGTACGATTCATTTCTCCCTCTTTGCACGCACGCGTGCACACACACACACACACAACACTACAACAGCAAACCCAAACGAAGAGGGAAGAAGAGAATCAACAGAAACCCTAGGGTACAACTCCATTTGCTCGAAGTACTA...

XM_057924667.1
CACTTATTTTTGTGAGATCTTCCTTTTTAGCGATGGCACCGAAAGCCCATAAAGCAAAATAAATTATACGCGGGCCCAGATTAAGAAACGCCCATTTATCCACACGTGCGAAGCCCACATTGTACGATTCATTTCTCCCTCTTTGCACGCACGCGTGCACACACACACACACACAACACTACAACAGCAAACCCAAACGAAGAGGGAAGAAGAGAATCAACAGAAACCCTAGGGTACAACTCCATTTGCTCGAAGTACTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999166
ATGGAAGCGGAAGATGATGCTGCGGGGGCTGTTATCGGGGACGAAGAGATCTACGCCAACGGCCGGGACGAAGGCGATTCGCAGCGGCACCGCCCCATCATCAGCGGCGAGCAGCTCGACATCGAGGCCTACGCCGCGCTGTACACCGGCCGCACAAAGATTACGCGCCTACTCTTCATCGCCGATAAATGCGACGTCCCTTCGATGGAGCTGGAGGCTCTGCGGATGGCGTACGACGAGATCAAGAAGGGCGAGAACAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780650.1
MEAEDDAAGAVIGDEEIYANGRDEGDSQRHRPIISGEQLDIEAYAALYTGRTKITRLLFIADKCDVPSMELEALRMAYDEIKKGENTQLFREVVGKINGRLGPNYGMDNAWADAVDRRAETRKEKLENELNAYRTNLIKESIRMGYNDFGDFYYAHGQLGEAFKNYVRTRDYCTTSKHIIHMCLNAILVSIEMGQFTHVTSYVSKAEQSQDALDPVTIAKLRCAAGLAHLEGKKYKLAARKFLEVGPELGNNYTEVIASQ...

XP_057780651.1
MEAEDDAAGAVIGDEEIYANGRDEGDSQRHRPIISGEQLDIEAYAALYTGRTKITRLLFIADKCDVPSMELEALRMAYDEIKKGENTQLFREVVGKINGRLGPNYGMDNAWADAVDRRAETRKEKLENELNAYRTNLIKESIRMGYNDFGDFYYAHGQLGEAFKNYVRTRDYCTTSKHIIHMCLNAILVSIEMGQFTHVTSYVSKAEQSQDALDPVTIAKLRCAAGLAHLEGKKYKLAARKFLEVGPELGNNYTEVIASQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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