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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004455`

染色体: Chr08 坐标: 54268315-54270094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004455`
名称	SmilChr08G004455
描述	putative ripening-related protein 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54268315 - 54270094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999179`
GeneID	`130999179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999179`
原始查询	`SmilChr08G004455`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative ripening-related protein 2
产物	putative ripening-related protein 2
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0637000` - identity=57.9; qcov=0.458; evalue=5.71e-59; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24300 (KWL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057780662.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057780662.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780662.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780662.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780662.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54268465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:54268478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C36
`Chr8:54268571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:54268589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B14,C50,C64
`Chr8:54268634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:54268699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,D4
`Chr8:54268720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:54269512`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A3,B110,B128,B130,B134,B138,B3,B44,B47,B5,B75,C28,C36,C53,C56,C70,C71,C84,D3
`Chr8:54269514`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A5
`Chr8:54269514`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A5
`Chr8:54269545`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B38
`Chr8:54269545`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780662.1

347 aa

174

347

KWL1

PF24300 KWL1 23-186 aa PF24300 KWL1 187-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780662.1`	Pfam	`PF24300`	KWL1	Domain	23	186	1.7e-124	413.8	Kiwellin-1
`XP_057780662.1`	Pfam	`PF24300`	KWL1	Domain	187	347	1.7e-124	413.8	Kiwellin-1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924679.1
TTTTTAAGGCTGGAAACTTTATAGTAACATATAATATCATCCCAATTCTGCATCCAACATTCATTCTTCCAATACTAATCCTAAACAAAACCGAGCTTTGAGATGAATTACTTCGGAAAAGGAGCCGTTCTTGTCTTGCTGCTCATCCTCGCTGCTCAGGCGTTGGAGGGCCGTCTCCAGTCTTGCAACCCGAGTGGCAAAATCAGAGGAAAGAAGCCACCTCCGGGGCAATGCAACCAGGAAAACGACTCCGACTGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999179
ATGAATTACTTCGGAAAAGGAGCCGTTCTTGTCTTGCTGCTCATCCTCGCTGCTCAGGCGTTGGAGGGCCGTCTCCAGTCTTGCAACCCGAGTGGCAAAATCAGAGGAAAGAAGCCACCTCCGGGGCAATGCAACCAGGAAAACGACTCCGACTGCTGCCAGCAAGGGAAGCTCTACACCACTTACAAATGCTCTCCACCCGTCTCTGGCAGCACGAAGGCAGTTCTCACCATCAACAGCTTCCAGAAGGGTGGAGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780662.1
MNYFGKGAVLVLLLILAAQALEGRLQSCNPSGKIRGKKPPPGQCNQENDSDCCQQGKLYTTYKCSPPVSGSTKAVLTINSFQKGGDGGGPSECDSQYHSDDTPVVALSTGWYSGGSRCLNNVTITGNGRSVTAMVVDECDSTMGCDDDHDYQPPCPNNIVDASKAVWKALGVPEGDWGELDITWSDTCKASGKIKGKKPPKGKCNRDHDSECCESGKFYKTFRCSPAVTGRTKAVLTLNGFGKGDDGGGAAACDGNFHSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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