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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004482`

染色体: Chr08 坐标: 54433594-54436689 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004482`
名称	SmilChr08G004482
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 17-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54433594 - 54436689 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999207`
GeneID	`130999207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999207`
原始查询	`SmilChr08G004482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 17-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 17-like
Arabidopsis	`AT4G25440` (ZFWD1) zinc finger WD40 repeat protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828649] identity=46.1; qcov=0.967; evalue=3.11e-137; confidence=high
Rice	`Os02g0677700` (OsC3H17) - identity=43.5; qcov=0.735; evalue=9.82e-90; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780692.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057780692.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780692.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780692.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54434506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:54434631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:54434768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C59
`Chr8:54434816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B88
`Chr8:54434831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B137,B34,B92,C70
`Chr8:54434863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:54435223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr8:54435392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B77,B97,C30
`Chr8:54435620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr8:54435631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B140
`Chr8:54435660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B88
`Chr8:54435665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780692.1

460 aa

230

460

WD40

PF00400 WD40 165-201 aa PF00400 WD40 288-322 aa PF00400 WD40 327-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780692.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	165	201	5.5e-29	100.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057780692.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	288	322	5.5e-29	100.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057780692.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	327	361	5.5e-29	100.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924709.1
ATAATGATTTTTCTCAAGCTTCGGTTTTCTTCTATTGATACAATAATTTTTTTTTTCGAACTCTCTAATCATTCAAAGAAATCAGGTTTGCTTTTTTCCTTTACCCTCGAAAATCTGTGTATATACTGTTTTGATTAAATTTTTCGGCGCTTTTCGATCGTCGACCGATTCGTTACGATCATGGGCTTACAAGACTCTGCGATGGTTGGATCGGAATCGTCTGATTTATCGTCTGGGCGCTTTAGGGTTGCGGAATTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999207
ATGGCGATCAAAACGGCGAGGAAAGAATCTGTCTTTGTTCGAATTGGTCAAACGCCTTTGAAGAACCAAGTTTGCATCTACTGGCTTGAAGGGAGATGCAACAAGGACCCATGTAGGTTCCTGCACAAACACAAAGAATCTCTGCCTTCAGAAACTGGGAGACGGCCGCTGCCTAATGCTAATCATTCCAAGACGTGGAGGAATCCTAACCATGACGGATCTCGTAAGGAAGGAGTTATATCCAATACTAAAAGTAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780692.1
MAIKTARKESVFVRIGQTPLKNQVCIYWLEGRCNKDPCRFLHKHKESLPSETGRRPLPNANHSKTWRNPNHDGSRKEGVISNTKSNPGKSGQRDQGMKTGRGGSDRVAVAQCQTKVVTVVRDVSEKRIVQKAQPKQCKYWITGNCVYGEKCKDLHSWFFGSGFTMLAKLEGHTKAITGISLPFGCEKLYSSSKDGTVRVWDSNNGQCVGSAMIGGGVGCLVAEGPLLFAGSENVVKVWNLQNQTEFSLDGAVGSVCSMIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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