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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004484`

染色体: Chr08 坐标: 54445857-54447201 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004484`
名称	SmilChr08G004484
描述	chlorophyll a-b binding protein 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54445857 - 54447201 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999209`
GeneID	`130999209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999209`
原始查询	`SmilChr08G004484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chlorophyll a-b binding protein 4, chloroplastic
产物	chlorophyll a-b binding protein 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G47470` (LHCA4) light-harvesting chlorophyll-protein complex I subunit A4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823901] identity=85.3; qcov=1; evalue=6.8e-161; confidence=high
Rice	`Os08g0435900` (cab) - identity=78.9; qcov=1; evalue=1.51e-142; confidence=high
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0009768 (photosynthesis, light harvesting in photosystem I); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00196 (Photosynthesis - antenna proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00504 (Chloroa_b-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780694.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057780694.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057780694.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780694.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54446120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:54446132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:54446279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B54,B57,B99
`Chr8:54446291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B50
`Chr8:54446318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C38
`Chr8:54446334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr8:54446430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,C28,C38
`Chr8:54446526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:54446538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C59
`Chr8:54446610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B114,C15,C45
`Chr8:54446616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:54446650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B95,C27,C53,C75,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780694.1

250 aa

125

250

Chloroa_b-bind

PF00504 Chloroa_b-bind 63-222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780694.1`	Pfam	`PF00504`	Chloroa_b-bind	Family	63	222	6.5e-47	160.7	Chlorophyll A-B binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924711.1
TAAGTGCAATGGATTCCCATTGGCCATTCACACTCAAATTTTAGATCTCTAAAATTTCCAAACTTTCAACCAACACCACAAACGCCAATACTACAAACTCACACACAAAAATATTCATTTATACCTCACATAACACAACACAGAGAAAAGAAAACTCCTCACTTCCATTCTTACATATCGGGAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTCAAAAAGAAAATGGCCGCAGTCACTACACAAGCCTCGGTCGCCATTCTCCGGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999209
ATGGCCGCAGTCACTACACAAGCCTCGGTCGCCATTCTCCGGCCGTGCGCGTCTAAAACCCGGTTCTTAACCGGTTCGTCCGGGAAATTGAACCGGGAAGTGTCGGTTAGGTCGGCAGTCTCATCCTACAATTCATCACTCAAGGTTGAAGCCAAGAAAGGCGAATGGCTCCCCGGATTGGCCTCTCCAACTTATCTCGACGGCAGTCTCGCAGGAGACAACGGATTTGATCCGTTGGGCCTGGCCGAGGACCCGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780694.1
MAAVTTQASVAILRPCASKTRFLTGSSGKLNREVSVRSAVSSYNSSLKVEAKKGEWLPGLASPTYLDGSLAGDNGFDPLGLAEDPENLRWFVQAELVNGRWAMLGVAGMLLPEVLTSAGLINVPKWYDAGKAEYFASSSTLFVIEFILFHYVEIRRWQDIKNPGSVNQDPIFKSYSLPPNEVGYPGGIFNPLNFAPTLEAKEKEVANGRLAMLAFLGFIIQHNVTGKGPFDNLLQHLSDPWHNTIIQTFN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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