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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004500`

染色体: Chr08 坐标: 54619052-54619927 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004500`
名称	SmilChr08G004500
描述	germin-like protein subfamily T member 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54619052 - 54619927 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999222`
GeneID	`130999222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999222`
原始查询	`SmilChr08G004500`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germin-like protein subfamily T member 2
产物	germin-like protein subfamily T member 2
Arabidopsis	`AT1G18980` (AT1G18980) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838479] identity=60.6; qcov=0.908; evalue=1.45e-83; confidence=high
Rice	`Os03g0804500` (GER7) - identity=52.8; qcov=0.991; evalue=1.24e-73; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057780710.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780710.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780710.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780710.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780710.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54619307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,B90,B98,C23
`Chr8:54619391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B130
`Chr8:54619407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C85,C87
`Chr8:54619420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:54619422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:54619497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:54619503`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B107,C13
`Chr8:54619503`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B107,C13
`Chr8:54619587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:54619592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:54619597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B136,B137,B34,C70
`Chr8:54619650`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780710.1

218 aa

109

218

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 73-210 aa PF07883 Cupin_2 99-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780710.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	73	210	8e-43	146.3	Cupin
`XP_057780710.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	99	170	1.4e-09	38.2	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924727.1
CCTATTGACTTTCATGAAACATGGCCTATATATAAATCAACCAAACCCCTCCACCAATATTCAAAAGATCAACCATGGTCTCAACCCTAATCCTACTCTTCTCCACGCTCATCTTCCTCTCCACACCACCACCTTCCCTCGCCGCGGACCCCGATCCGCTGCAGGACTTCTGCATCGCGGATCTCCAAGCCCCGACCACCGTCAACGGCTTCCCCTGCAAACCATCCCCGAACGTGACGTCAAACGACTTCTTCTTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999222
ATGGTCTCAACCCTAATCCTACTCTTCTCCACGCTCATCTTCCTCTCCACACCACCACCTTCCCTCGCCGCGGACCCCGATCCGCTGCAGGACTTCTGCATCGCGGATCTCCAAGCCCCGACCACCGTCAACGGCTTCCCCTGCAAACCATCCCCGAACGTGACGTCAAACGACTTCTTCTTCAACGGCCTAGCCCGGGGGGGCGACACGGGCAGCAGCCCCTTCGGCAGCAGCGTGGTATTGGGCAACGTTCTCGCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780710.1
MVSTLILLFSTLIFLSTPPPSLAADPDPLQDFCIADLQAPTTVNGFPCKPSPNVTSNDFFFNGLARGGDTGSSPFGSSVVLGNVLAFPALNTLGISMNRVDIAPGGINPPHSHPRATEAGVVVQGRLLVGLISTSNVLYAKNLTAGEMFVIPRGLVHFQMNVGEEKALIYTAFNSHLPGAVVVSPTLFGARPSVPNDVLTKTFQVDQSVVDQIKSKFD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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