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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004501`

染色体: Chr08 坐标: 54622563-54623483 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004501`
名称	SmilChr08G004501
描述	germin-like protein 1-1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54622563 - 54623483 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999223`
GeneID	`130999223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999223`
原始查询	`SmilChr08G004501`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germin-like protein 1-1
产物	germin-like protein 1-1
Arabidopsis	`AT1G18980` (AT1G18980) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838479] identity=57.4; qcov=0.824; evalue=1.59e-79; confidence=high
Rice	`Os03g0651800` (OsGLP3-2) - identity=53.5; qcov=0.9; evalue=4.05e-78; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057780711.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780711.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780711.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780711.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54622863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:54622919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:54622935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B140
`Chr8:54622944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr8:54623027`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr8:54623027`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr8:54623031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B140
`Chr8:54623055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B130
`Chr8:54623074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:54623075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:54623121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,B87,C11,C53
`Chr8:54623169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B41,C3,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780711.1

239 aa

120

239

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 86-228 aa PF07883 Cupin_2 120-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780711.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	86	228	1.3e-45	155.4	Cupin
`XP_057780711.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	120	191	5e-09	36.5	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924728.1
CTCAAACTCTCCACCAACATGGCAAAGAGAGATCATCTTCTCCCAATGGCCTCCACACTCACCCAATCACCTCACCACCCAACCTTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTCTCCACACTCATCCTACTCTCATCACCACCACCCTCTCTCGCCTCCGATCCTGACCCGCTGCAGGACTTCTGCATCGCGGACCTCCGGGCCCCGATCTCCGTGAACGGCTTCCCCTGCAAACCATCCCCAAACGTGACATCGGACGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999223
ATGGCAAAGAGAGATCATCTTCTCCCAATGGCCTCCACACTCACCCAATCACCTCACCACCCAACCTTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTCTCCACACTCATCCTACTCTCATCACCACCACCCTCTCTCGCCTCCGATCCTGACCCGCTGCAGGACTTCTGCATCGCGGACCTCCGGGCCCCGATCTCCGTGAACGGCTTCCCCTGCAAACCATCCCCAAACGTGACATCGGACGACTTCTTCTTCGACGGGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780711.1
MAKRDHLLPMASTLTQSPHHPTLTLTLTLTLSTLILLSSPPPSLASDPDPLQDFCIADLRAPISVNGFPCKPSPNVTSDDFFFDGLAREGDTYNSNGSSVVYGNVLAFPALNTLGISMNRVDVAPGGLNPPHSHPRATEAGIVVQGKLLVGMITTSNVLYAKNVTAGEMFVIPRGLVHFQMNVGNETALIYAAFNSHLPGSVFVASNLFGARPPVPDDVLTKAFQVEQRLIAQIRSKFG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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