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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004522`

染色体: Chr08 坐标: 54796119-54797830 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004522`
名称	SmilChr08G004522
描述	cystathionine beta-lyase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54796119 - 54797830 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999240`
GeneID	`130999240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999240`
原始查询	`SmilChr08G004522`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cystathionine beta-lyase, chloroplastic-like
产物	cystathionine beta-lyase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G57050` (CBL) cystathionine beta-lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824872] identity=83; qcov=0.618; evalue=6.07e-49; confidence=medium
Rice	`Os06g0176900` - identity=88.4; qcov=0.625; evalue=6.54e-47; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016846 (carbon-sulfur lyase activity); GO:0019346 (transsulfuration); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF01053 (Cys_Met_Meta_PP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780732.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780732.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780732.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780732.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54796824`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A8,B107,B118,B37,B71,B79,B8,D2,D3
`Chr8:54796848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B10,C82
`Chr8:54796848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B10,C82
`Chr8:54796850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C82
`Chr8:54797326`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B132,C47,C57
`Chr8:54797326`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B132,C47,C57
`Chr8:54797403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B91,C30,C76,C77,D11
`Chr8:54797551`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B95,C45
`Chr8:54797551`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B95,C45
`Chr8:54797566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr8:54797571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B88,C3,D2
`Chr8:54797589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780732.1

153 aa

153

Cys_Met_Meta_PP

PF01053 Cys_Met_Meta_PP 56-148 aa

XP_057780733.1

152 aa

152

Cys_Met_Meta_PP

PF01053 Cys_Met_Meta_PP 55-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780732.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	56	148	7.9e-30	104.4	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
`XP_057780733.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	55	147	7.7e-30	104.4	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093452.1
TTATCACTGTCATGTTTGCCCAATGACCAAATCAAAAAAGATTTATTAAAGTTGAACAATGAAGAACACAAGAACCAATTGCAACTATACTATGTTTCAAATCAGTGAGAAGTATCATTACTCCACAGGTGCCCTTTGAGAAATTTGGAAGTATTAAATTCAGAAGTATTAGGCTATGCGATCACTCGTTTTATTACCATTATGCAGAAAATTTTCAAGTGTTTTAGCTCTCTGTTTATCCTTTATCTTGCCATTTGCTA...

XR_009093451.1
CATGTTTGCCCAATGACCAAATCAAAAAAGATTTATTAAAGTTGAACAATGAAGAACACAAGAACCAATTGCAACTATACTATGTTTCAAATCAGTGAGAAGTATCATTACTCCACAGGTGCCCTTTGAGAAATTTGGAAGTATTAAATTCAGAAGTATTAGGCTATGCGATCACTCGTTTTATTACCATTATGCAGAAAATTTTCAAGTGTTTTAGCTCTCTGTTTATCCTTTATCTTGCCATTTGCTATTTGATGTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999240
ATGGATGTCAGCACGTCTGCTTTGGTTGATGGAGTTGCCGAATGCACAAATGAAGAAGAGATCATACAAACAAGTCGCCAAGTGGAGCCAAGTGTTTCCACGGTGTTGATGAATTTTTCCAATGACTTTGATCCTTATGAGGCTTTAAGCACACCTCTATATCAAACAGCAACTTTCAAGCAGGCGAAGGGTGCAGGATCCGTGCTGAGCTTCTTAACGGGGTCGCTGGCTCTCTCCAAGCACGTCGTTGAGACGACAAA...

LOC130999240
ATGGATGTCAGCACGTCTGCTTTGGTTGATGGAGTTGCCGAATGCACAAATGAAGAGATCATACAAACAAGTCGCCAAGTGGAGCCAAGTGTTTCCACGGTGTTGATGAATTTTTCCAATGACTTTGATCCTTATGAGGCTTTAAGCACACCTCTATATCAAACAGCAACTTTCAAGCAGGCGAAGGGTGCAGGATCCGTGCTGAGCTTCTTAACGGGGTCGCTGGCTCTCTCCAAGCACGTCGTTGAGACGACAAAGTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780732.1
MDVSTSALVDGVAECTNEEEIIQTSRQVEPSVSTVLMNFSNDFDPYEALSTPLYQTATFKQAKGAGSVLSFLTGSLALSKHVVETTKYFSITVSFGSVKSLISLPCFMSHASIPAAVREARGLTEDLVRVSVGIEDADDLISDLEHALRTGPA

XP_057780733.1
MDVSTSALVDGVAECTNEEIIQTSRQVEPSVSTVLMNFSNDFDPYEALSTPLYQTATFKQAKGAGSVLSFLTGSLALSKHVVETTKYFSITVSFGSVKSLISLPCFMSHASIPAAVREARGLTEDLVRVSVGIEDADDLISDLEHALRTGPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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