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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004527`

染色体: Chr08 坐标: 54819436-54821809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004527`
名称	SmilChr08G004527
描述	adenylate isopentenyltransferase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54819436 - 54821809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998700`
GeneID	`130998700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998700`
原始查询	`SmilChr08G004527`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate isopentenyltransferase 1, chloroplastic-like
产物	adenylate isopentenyltransferase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G68460` (IPT1) isopentenyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843175] identity=42.9; qcov=0.747; evalue=5.04e-40; confidence=medium
Rice	`Os05g0551700` (OsIPT7) - identity=38.4; qcov=0.7; evalue=7.41e-29; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0009824 (AMP dimethylallyltransferase activity); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01715 (IPPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057780095.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057780095.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54819458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C82,C85
`Chr8:54819485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C82,C85
`Chr8:54819504`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A11,A2,A20,A23,A25,A6,B103,B106,B120,B125,B140,B15,B23,B24,B31,B41,B42,B45,B7,B73,B74,B80,B81,B82,B83,B85,B86,C10,C24,C25,C33,C35,C36,C50,C52,C58,C60,C65,C67,C7,C78,C79,D3,D5
`Chr8:54819506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:54819507`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A11,A2,A20,A23,A25,A6,B103,B106,B120,B125,B140,B15,B23,B24,B31,B41,B42,B45,B7,B73,B74,B80,B81,B82,B83,B85,B86,C10,C24,C25,C33,C35,C36,C50,C52,C58,C60,C65,C67,C7,C78,C79,D3,D5
`Chr8:54820098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B95,C34
`Chr8:54820105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B24,B8,C30,C51
`Chr8:54820112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B136,B58,B99
`Chr8:54820125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr8:54820145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:54820186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C87
`Chr8:54820256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780095.1

253 aa

126

253

IPPT

PF01715 IPPT 93-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780095.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	93	126	1.6e-11	45.1	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924112.1
ATGGATGGAATCAAAGCTTCTGGATTGAGGGTTTCTGAAGCAGCGGCATCGCCATGGCAGGGAAGGGAGAGCTTAATTATCACTGCTCCAATTTCAAACGCGTCATCACAAGACACCACCGTTTCGCAGGTGCGCCGCGAAGATGGCCTCTGTCGCCGCCGCCACAGGAAGATAGTGGTGGTGATGGGCCCCACGGGCTGCGACAAGACCAAGCTCTCCATCGACTTGGCGTCGAGATTCTTCCGATCATCGGAGATCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998700
ATGGATGGAATCAAAGCTTCTGGATTGAGGGTTTCTGAAGCAGCGGCATCGCCATGGCAGGGAAGGGAGAGCTTAATTATCACTGCTCCAATTTCAAACGCGTCATCACAAGACACCACCGTTTCGCAGGTGCGCCGCGAAGATGGCCTCTGTCGCCGCCGCCACAGGAAGATAGTGGTGGTGATGGGCCCCACGGGCTGCGACAAGACCAAGCTCTCCATCGACTTGGCGTCGAGATTCTTCCGATCATCGGAGATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780095.1
MDGIKASGLRVSEAAASPWQGRESLIITAPISNASSQDTTVSQVRREDGLCRRRHRKIVVVMGPTGCDKTKLSIDLASRFFRSSEIVNSDKIQIHRGLDITTNKIPPRDRENVPHHLLGQFDSSESHPEFTPSDFRLVRVAPRVHLRIAGGEIRPRVGRVHRVQGAEVQYKCCFIWVNVSSAVLAEHLVRRVDDMLGSGMFKELAEYFGGCEWDSILIRNEFCSYLELWPEIVKLTPCAMEIGTVASPKLHYR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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