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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004529`

染色体: Chr08 坐标: 54839527-54840955 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004529`
名称	SmilChr08G004529
描述	uncharacterized SmilChr08G004529
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54839527 - 54840955 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999245`
GeneID	`130999245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999245`
原始查询	`SmilChr08G004529`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox184; symbol=OsFbox184; hit=Os04g0194000; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox184; symbol=OsFbox184; hit=Os04g0194000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0194000` (OsFbox184) - identity=23.5; qcov=0.899; evalue=9.86e-12; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999245

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780740.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780740.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54839624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B105
`Chr8:54839624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:54839643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B114,B83,B87,D4
`Chr8:54839861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B34
`Chr8:54839928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:54839935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D1
`Chr8:54840030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B117,B127,B137,B34
`Chr8:54840100`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B134,B25,B39,B64,C28,C36,C55,C70
`Chr8:54840101`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B134,B25,B39,B64,C28,C36,C55,C70
`Chr8:54840139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C82
`Chr8:54840159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:54840214`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B128,B86,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780740.1

386 aa

193

386

F-box

F-box-like

FBA_3

PF00646 F-box 46-81 aa PF12937 F-box-like 49-80 aa PF08268 FBA_3 126-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780740.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	46	81	1.9e-06	28.3	F-box domain
`XP_057780740.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	49	80	2.2e-07	31.2	F-box-like
`XP_057780740.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	126	371	3.3e-09	36.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924757.1
CTCAACACATACAAAAGAGAGACAAAAAAAAAATCAAATTATGTTTTGGCGGGAAAATAGAATTGTTGCAAATGGATAGTCTTCCACCGCCACCGCGGCCCAGCCGGTGCAGTGAAGGCTCGCTGATTGGGGTTCAGTTTCCGAGTGTTCGAACTCGCCCTTACTATTTTAGGAGGTGTAAAACGGTGAATCCGACAAGTATAGAGTCTCTCCTCGACGAGCTGTTGATAGAAATCCTGGTACGTCTCTCAGCTGATGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999245
ATGGATAGTCTTCCACCGCCACCGCGGCCCAGCCGGTGCAGTGAAGGCTCGCTGATTGGGGTTCAGTTTCCGAGTGTTCGAACTCGCCCTTACTATTTTAGGAGGTGTAAAACGGTGAATCCGACAAGTATAGAGTCTCTCCTCGACGAGCTGTTGATAGAAATCCTGGTACGTCTCTCAGCTGATGATCTTTACGCCAATGTAAGGCTGGTGTGTCGCAGATGGTACCATCTAATCCATTTCAAACCTTTCGTGTACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780740.1
MDSLPPPPRPSRCSEGSLIGVQFPSVRTRPYYFRRCKTVNPTSIESLLDELLIEILVRLSADDLYANVRLVCRRWYHLIHFKPFVYAHLNHTSYGLLLSYSSDYLIFITATTQGRIEVSNLGYVIRFRHVSSCNGLTVGLEFCGKYAAFIVNPATKCRFSLPPLPVGGESGFLGIAYAAASMEYKVVLTYIVDRIHKCAILTVGVDKTWRSVAIAKSIGILQTPLIIQGFMLWLLERTRIMTLNVESEVMREIHVPIFPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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