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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004530`

染色体: Chr08 坐标: 54842240-54843400 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004530`
名称	SmilChr08G004530
描述	uncharacterized SmilChr08G004530
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54842240 - 54843400 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998702`
GeneID	`130998702`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998702`
原始查询	`SmilChr08G004530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G64950` (AT5G64950) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619] identity=26.6; qcov=0.943; evalue=4.56e-35; confidence=low
Rice	`Os06g0225200` - identity=29.3; qcov=0.85; evalue=1.16e-31; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998702

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780097.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780097.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780097.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780097.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54842325`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A1,A18,A3,B119,B122,B127,B13,B131,B46,B5,B55,B8,B88,B90,B98,C13,C16,C22,C27,C30,C36,C65,C71,C72,C84,D11,D8
`Chr8:54842355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B83,C20,C24,C51
`Chr8:54842461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:54842472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C73
`Chr8:54842492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr8:54842522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:54842524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B88
`Chr8:54842531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B88
`Chr8:54842542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B20,B93,C71
`Chr8:54842636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B122,B129,B13,B29,C41
`Chr8:54842636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B129,B13,B29,C41
`Chr8:54842749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B8,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780097.1

386 aa

193

386

mTERF

PF02536 mTERF 43-203 aa PF02536 mTERF 249-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780097.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	43	203	4.5e-29	102.1	mTERF
`XP_057780097.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	249	348	4.5e-29	102.1	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924114.1
ATGATTGCAGTTGCACGCAGGAATCTCTCTTGTTTATTTGTAAACCCTAATTCATTTCTCTGCAACTCCAATGCTCAACTCTTCCCGTCAATCCATTTCTTATCCACTTGGAGGGTGAAAAACCTAATCCCTAACCCTGAAATCTACGATCTATTGCTCAACAAACACCAATTTCCTCCTGAATTAGCTTCAATAGCTTCATCGGGTTTACCTAAAGCTAGTAGCCCCATAGGAGCTGATTCAGTAGTGTCATTCCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998702
ATGATTGCAGTTGCACGCAGGAATCTCTCTTGTTTATTTGTAAACCCTAATTCATTTCTCTGCAACTCCAATGCTCAACTCTTCCCGTCAATCCATTTCTTATCCACTTGGAGGGTGAAAAACCTAATCCCTAACCCTGAAATCTACGATCTATTGCTCAACAAACACCAATTTCCTCCTGAATTAGCTTCAATAGCTTCATCGGGTTTACCTAAAGCTAGTAGCCCCATAGGAGCTGATTCAGTAGTGTCATTCCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780097.1
MIAVARRNLSCLFVNPNSFLCNSNAQLFPSIHFLSTWRVKNLIPNPEIYDLLLNKHQFPPELASIASSGLPKASSPIGADSVVSFLKENSFTATQLQKVVTYNPRILGFTIESINLKFKVFQSLGLSPKEIAKIISEHTTSLHSSYENSIIPKLSMLKCLLGSDHNVARLLKRCSWFLSADLEKTLMPNMEILKSYSIPMVHILHFLHLRPRCFVVKPDIMQKSVVRAIEFGVPWTSGVFIQAVSLFTHTSEGMWEVKVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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