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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004544`

染色体: Chr08 坐标: 55038529-55039446 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004544`
名称	SmilChr08G004544
描述	6,7,8-trihydroxycoumarin synthase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55038529 - 55039446 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998709`
GeneID	`130998709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998709`
原始查询	`SmilChr08G004544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	6,7,8-trihydroxycoumarin synthase-like
产物	6%2C7%2C8-trihydroxycoumarin synthase-like
Arabidopsis	`AT4G31500` (CYP83B1) cytochrome P450, family 83, subfamily B, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829277] identity=38.9; qcov=0.869; evalue=5.07e-68; confidence=medium
Rice	`Os12g0512800` (OsCYP71E5) - identity=35; qcov=0.908; evalue=7.96e-47; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057780103.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057780103.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780103.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780103.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780103.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55038548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C35
`Chr8:55038697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:55038705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B5,C17,D4
`Chr8:55038797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B15,C18
`Chr8:55038806`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A10,A2,B108,B24,B25,B68,B90,C21,C45,D5
`Chr8:55038823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C11,C53,C69
`Chr8:55038833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B21,C10,C50,C52
`Chr8:55038888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:55038908`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A20,A6,A7,A8,B101,B107,B11,B117,B127,B138,B16,B60,B70,B71,B78,C22,C34,C43,C44,C57,C68,D6
`Chr8:55038922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B108,C45
`Chr8:55038938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:55039057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780103.1

305 aa

152

305

p450

PF00067 p450 33-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780103.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	33	289	1.1e-33	117.5	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924120.1
ATGCAATTTATTTTAATTTTATTCTTAGCTCTTCCCATAATCCTCATCCTCTACTCCAAAACACAAAACCCTAAGCATGCCCAAAAAGAACTCCCTCCACCGGGCCCACCGCGGCTGCCGTTCATCGGCAATCTGCACCAATTCGACGGCCGATCCCCGCACACGTACCTCCGCCGCCTCTCGAAGCAGTACGGCGCCGTCATGTCCCTCCAGCTCGGATTCCGGCAGCTCGTCGTGATCTCCTCCGCAGAGGCAGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998709
ATGCAATTTATTTTAATTTTATTCTTAGCTCTTCCCATAATCCTCATCCTCTACTCCAAAACACAAAACCCTAAGCATGCCCAAAAAGAACTCCCTCCACCGGGCCCACCGCGGCTGCCGTTCATCGGCAATCTGCACCAATTCGACGGCCGATCCCCGCACACGTACCTCCGCCGCCTCTCGAAGCAGTACGGCGCCGTCATGTCCCTCCAGCTCGGATTCCGGCAGCTCGTCGTGATCTCCTCCGCAGAGGCAGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780103.1
MQFILILFLALPIILILYSKTQNPKHAQKELPPPGPPRLPFIGNLHQFDGRSPHTYLRRLSKQYGAVMSLQLGFRQLVVISSAEAVKEIMKSHDTVFSSRPALAALRRLSYDGLDFAFSPYTETSREMKKISTVHLFNTKQVQTFLPIIRDEASKMMEKIATDASSSAATDLSETIMSFAANTVARVVLGKSYGNFFHLLHDAEAVLGDLFMEDFLPWLRWIDNLSGMAAKLDKIFQDMDAFCEEVIEEHMNPNRPKSME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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