当前解析结果
SmilChr08G004547| 统一基因 ID | SmilChr08G004547 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004547 |
| 描述 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 55064890 - 55065758 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998712 |
|---|---|
| GeneID | 130998712 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130998712 |
| 原始查询 | SmilChr08G004547 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 2-like |
| 产物 | gibberellin 2-beta-dioxygenase 2-like |
| 拟南芥 | AT1G30040 (GA2OX2)gibberellin 2-oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839883] identity=49.3; qcov=0.497; evalue=4.97e-17; confidence=low |
| 水稻 | Os01g0332200 (GA2OX2)- identity=42.86; qcov=0.441; evalue=3.97e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998712 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞核 | 0.80000 | SmilChr08G004547.1 |
| 2 | 细胞质 | 0.60000 | SmilChr08G004547.1 |
| 3 | 细胞质基质 | 0.20000 | SmilChr08G004547.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:55065179 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr8:55065190 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B124,B17,D9 |
Chr8:55065190 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B124,B17,D9 |
Chr8:55065285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B29,B92,C9 |
Chr8:55065302 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B124,B85,C53,C81 |
Chr8:55065493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C10,C58,C83 |
Chr8:55065505 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B29,B92,C11,C50,C54 |
Chr8:55065543 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B17,D9 |
Chr8:55065603 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,C83,D9 |
Chr8:55065738 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr8:55065748 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”;序号在当前参考发布内固定,来源 accession 同时保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。