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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004554`

染色体: Chr08 坐标: 55122925-55123807 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004554`
名称	SmilChr08G004554
描述	uncharacterized SmilChr08G004554
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55122925 - 55123807 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999262`
GeneID	`130999262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999262`
原始查询	`SmilChr08G004554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780755.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057780755.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057780755.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780755.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55123014`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A18,A22,A6,B106,B107,B111,B112,B113,B120,B122,B128,B13,B132,B137,B2,B31,B45,B47,B53,B54,B57,B61,B68,B72,B78,B84,B95,B96,B97,C17,C38,C47,C5,C56,C57,C76,C77,C8,C80,C81,C84,C85,C9,D5,D6
`Chr8:55123019`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	60	A16,A18,A5,B102,B106,B107,B11,B114,B12,B120,B122,B126,B127,B128,B13,B130,B132,B22,B25,B31,B53,B55,B56,B58,B59,B62,B63,B66,B69,B77,B78,B83,B85,B89,B90,B92,B97,C13,C21,C29,C31,C33,C35,C38,C47,C5,C57,C58,C62,C7,C70,C73,C77,C79,C8,C81,C83,C84,C85,C9
`Chr8:55123042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C21,C68
`Chr8:55123158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B35,B55,C44
`Chr8:55123178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A14,B100,B106,B109,B125,B137,B29,B6,B67,B7,B76,B85,B95,B98,C2,C26,C38,C39,C48,C53,C70,C73,D1
`Chr8:55123210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B75
`Chr8:55123263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C80
`Chr8:55123381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B66,C37,C47
`Chr8:55123386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:55123392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:55123395`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B24
`Chr8:55123395`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780755.1

159 aa

159

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 7-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780755.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	7	92	1.6e-06	28.7	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924772.1
TATTGCTTTACGGGAATTATTGACAAAGTTGAAAATAAAGTAACAATAAAAATTGCAACACATCTTTCTCCAAAATTGATGAGAGTGCAATATGCAAAAAAATGCAATGAAGAAGTTCTTGAGACATCTCTCAGATACAGAATCACAATAAATGTTATACAAGGCGACTGCAATGCACGTGTTACACTATTCGATCAAGCGGCAGAGGTATATGTAGGATGCTCTGTGGATGAATATATTTCTTCAATCAAAGAGGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999262
ATGAGAGTGCAATATGCAAAAAAATGCAATGAAGAAGTTCTTGAGACATCTCTCAGATACAGAATCACAATAAATGTTATACAAGGCGACTGCAATGCACGTGTTACACTATTCGATCAAGCGGCAGAGGTATATGTAGGATGCTCTGTGGATGAATATATTTCTTCAATCAAAGAGGGTGAAACAGACTCCACATACTATAGAGGATTAAGCACACAAGCGTACACACAAATGCGCTTCATGACGATGCTCAAGTTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780755.1
MRVQYAKKCNEEVLETSLRYRITINVIQGDCNARVTLFDQAAEVYVGCSVDEYISSIKEGETDSTYYRGLSTQAYTQMRFMTMLKFIKFDQRGNLNIVANAIQKTQPIESIDVGDIEEDPTQVEEKKHSPEKSKKKIPSRKKNLRWNCSPQNRKRKKEG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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