当前解析结果
SmilChr08G004580| 统一基因 ID | SmilChr08G004580 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004580 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004580 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 55376107 - 55377003 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998725 |
|---|---|
| GeneID | 130998725 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130998725 |
| 原始查询 | SmilChr08G004580 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| 拟南芥 | -- |
| 水稻 | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998725 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞核 | 1.00000 | SmilChr08G004580.1 |
| 2 | 核质 | 0.40000 | SmilChr08G004580.1 |
| 3 | 细胞质 | 0.20000 | SmilChr08G004580.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:55376132 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B61 |
Chr8:55376150 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,B130,B5 |
Chr8:55376161 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B77,C73 |
Chr8:55376161 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B77,C73 |
Chr8:55376169 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 48 | A13,A18,A2,A20,A25,B108,B110,B118,B123,B126,B127,B128,B130,B132,B134,B136,B21,B22,B23,B32,B39,B48,B50,B6,B65,B66,B68,B7,B77,B78,B83,B94,C11,C15,C2,C25,C33,C38,C56,C59,C73,C75,C80,C81,C83,D10,D2,D9 |
Chr8:55376174 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B1,B119 |
Chr8:55376186 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B126,B132,C15,C56,C80,C83,D2,D9 |
Chr8:55376188 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B17,B71,B80,C1,D6 |
Chr8:55376189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B29 |
Chr8:55376215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B30,B59,C27 |
Chr8:55376223 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,B37 |
Chr8:55376250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”;序号在当前参考发布内固定,来源 accession 同时保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。