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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004586`

染色体: Chr08 坐标: 55422519-55423333 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004586`
名称	SmilChr08G004586
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55422519 - 55423333 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998728`
GeneID	`130998728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998728`
原始查询	`SmilChr08G004586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
产物	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
Arabidopsis	`AT3G10400` (U11/U12-31K) RNA recognition motif and CCHC-type zinc finger domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820203] identity=78.8; qcov=0.482; evalue=2.87e-66; confidence=medium
Rice	`Os09g0549500` - identity=77.5; qcov=0.527; evalue=1.59e-68; confidence=medium
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780120.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780120.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057780120.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780120.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55422521`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B126,B41,B71,B89,C1,C70
`Chr8:55422522`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B30,B76,B88,C64,C66,C74
`Chr8:55422545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:55422575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B52,C9
`Chr8:55422594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B52,C9
`Chr8:55422595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C30
`Chr8:55422600`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B41,C70,C85
`Chr8:55422600`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B41,C70,C85
`Chr8:55422608`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B30,B72,B76,B88,C64,C66,C74,D5
`Chr8:55422613`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B30,B72,B76,B88,C64,C66,C74,D5
`Chr8:55422626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr8:55422629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780120.1

245 aa

122

245

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 36-106 aa PF00098 zf-CCHC 130-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780120.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	36	106	1.1e-19	70.7	RNA recognition motif
`XP_057780120.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	130	145	7.8e-06	26.5	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924137.1
TGAGTTCGAAAATCATCTCGAGCTGCAATCCAACACTCCATGTTGAGTCAATTCCCCAAACAAAATCACCCCAAATTATGTCCTTCAGTTCCCAGCTAATTATCAAGTCAAGAAAGCCATCGAAGGCCCGCGCCACGGCCCGAATCTCAGCCTCATACGCCCCTGCCCGAACCAAGGAGACACTGTACGTCAGCAACATCGACTACAACCTGACCAACTCCGACCTCCACACGATCTTCTCCACCTTCGGCAAGCTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998728
ATGTCCTTCAGTTCCCAGCTAATTATCAAGTCAAGAAAGCCATCGAAGGCCCGCGCCACGGCCCGAATCTCAGCCTCATACGCCCCTGCCCGAACCAAGGAGACACTGTACGTCAGCAACATCGACTACAACCTGACCAACTCCGACCTCCACACGATCTTCTCCACCTTCGGCAAGCTCGCCAAGGTCACGGTGCTCAAGGACCGCGCCACGCGCCAGAGCAAGGGCGTGGCGTTCGTCCTCTTCGTCCGCCGCGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780120.1
MSFSSQLIIKSRKPSKARATARISASYAPARTKETLYVSNIDYNLTNSDLHTIFSTFGKLAKVTVLKDRATRQSKGVAFVLFVRREDAARAAKEMDGKILNGRTLRASIAGDNGRATEFIKKKVYKDKSRCYECGEEGHLSYECPRNFLGPRELPPPPKKGRRGGSSGGESRGRDFEGEAAGGNWGELKSGIGFGVFTPNPPSFPNSHKGPHFMQTTPPSSEILRKPPLDCSELQKLPHVMRITP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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