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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004590`

染色体: Chr08 坐标: 55467142-55469448 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004590`
名称	SmilChr08G004590
描述	COBRA-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55467142 - 55469448 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999291`
GeneID	`130999291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999291`
原始查询	`SmilChr08G004590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COBRA-like protein 7
产物	COBRA-like protein 7
Arabidopsis	`AT4G16120` (COBL7) COBRA-like protein-7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827298] identity=58.9; qcov=0.919; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0685100` - identity=45.5; qcov=0.914; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0010215 (cellulose microfibril organization); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04833 (COBRA_N); PF25079 (COB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780784.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057780784.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780784.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780784.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55467161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr8:55467189`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A1,B123,B127,B22,B41,B44,C40,C57,C58,C63,C66,D8
`Chr8:55467212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C78
`Chr8:55467279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B33
`Chr8:55467306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B70,B72,B76,C38
`Chr8:55467335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr8:55467348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B68,B69,C14
`Chr8:55467354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B40,B66
`Chr8:55467360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B110,B52,B54
`Chr8:55467384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr8:55467484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:55468369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780784.1

664 aa

332

664

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 238-417 aa PF25079 COB_C 426-636 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780784.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	238	417	6.9e-62	209.0	COBRA N-terminal domain
`XP_057780784.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	426	636	4.1e-92	308.6	COBRA family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924801.1
ATGATCTTCTTTGATGACCGAAATTTCTCGAGTATGACAATGGCCACTACTTTCTTCCCTATTTCCACGGCGTTGCTCTCTGTCTTGGCGATTTTCCCTCTTTTTTGCTATCTCCCCACCTGCCTTGCTCAGTCCCTCTGCAACGACGGCGTTTTAATCACGTACAACAATAACTCGACCGAGCTAATCCCGCCGTTTCTTAATCCGGTCAACCTGCCCGACCAGCCGTACCGGTTCAGGTCGACGCTGACGGTTCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999291
ATGATCTTCTTTGATGACCGAAATTTCTCGAGTATGACAATGGCCACTACTTTCTTCCCTATTTCCACGGCGTTGCTCTCTGTCTTGGCGATTTTCCCTCTTTTTTGCTATCTCCCCACCTGCCTTGCTCAGTCCCTCTGCAACGACGGCGTTTTAATCACGTACAACAATAACTCGACCGAGCTAATCCCGCCGTTTCTTAATCCGGTCAACCTGCCCGACCAGCCGTACCGGTTCAGGTCGACGCTGACGGTTCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780784.1
MIFFDDRNFSSMTMATTFFPISTALLSVLAIFPLFCYLPTCLAQSLCNDGVLITYNNNSTELIPPFLNPVNLPDQPYRFRSTLTVLNNGRQELKNWRVFVGFEHGELLVSAANAVLADGALLPANVSGGAVFSGSSPTDLKTAIETAGDVNQMRAVVELVGTEFGVAPPNASLPGNITLANDGYLCQNLTTQGNIMNTCCTLDTNTETNITRGQEFSPLQTGDVTIMYDVLMTYDPNYWAQLTISNHNPFGRLDNWEVSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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