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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004601`

染色体: Chr08 坐标: 55595735-55598623 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004601`
名称	SmilChr08G004601
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55595735 - 55598623 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998732`
GeneID	`130998732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998732`
原始查询	`SmilChr08G004601`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=31.9; qcov=0.679; evalue=4.22e-69; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=34.4; qcov=0.507; evalue=1.47e-69; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780124.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780124.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780124.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780124.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55595756`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C53,C83
`Chr8:55595756`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C53,C83
`Chr8:55595772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B78,C85
`Chr8:55595808`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A19,A21,A24,A4,B105,B109,B120,B126,B129,B14,B26,B53,B65,B81,B82,B91,C13,C16,C19,C26,C27,C29,C30,C32,C36,C42,C52,C53,C54,C55,C69,C74,C79,C8,C81,D1,D9
`Chr8:55595812`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	38	A19,A21,A24,A4,B105,B109,B120,B126,B129,B14,B26,B53,B65,B81,B82,B91,C13,C16,C19,C26,C27,C29,C30,C32,C36,C42,C44,C52,C53,C54,C55,C69,C74,C79,C8,C81,D1,D9
`Chr8:55595821`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A19,A21,B120,B14,B15,B53,C16,C19,C26,C69
`Chr8:55595828`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A10,B90,B97,C22,C44,C61
`Chr8:55595859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B24,B53,C82
`Chr8:55595907`	`ACG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr8:55596054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:55596124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:55596139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780124.1

962 aa

481

962

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 169-334 aa PF23559 WHD_DRP 418-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780124.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	169	334	3.5e-41	141.4	NB-ARC domain
`XP_057780124.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	418	489	1.1e-20	74.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924141.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTTTGATGAACAATATTGAGCAGATGATGTGCCATCCTCGCCTTTCAACTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCATTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTGATTACCAACTGTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTTATTGAATCACACATTGTCGATCAAATTCATGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998732
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTTTGATGAACAATATTGAGCAGATGATGTGCCATCCTCGCCTTTCAACTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCATTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTGATTACCAACTGTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTTATTGAATCACACATTGTCGATCAAATTCATGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780124.1
MAAYAALVSLMNNIEQMMCHPRLSTVFDKKQIESIGEKADGLLDLITNCNIDGGSKEASDLESQIASAAHAAEDVIESHIVDQIHAGENPAWMRWCWLWRNSCLWLWRNPCFLDLQQIIEEMDGIMRNGAELKEKWGAREEQATHGEMDAVEEKQPLTTTRKASPVGLEDDVINVMDKLTIHQPKQQIISIVGMGGTGKTTLALNVYENSLIKEHFHIRAWATVSQQYSAQEIFSKLLSSIGQKGSGDELGLKLYQTLCG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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