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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004606`

染色体: Chr08 坐标: 55629888-55632575 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004606`
名称	SmilChr08G004606
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55629888 - 55632575 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998737`
GeneID	`130998737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998737`
原始查询	`SmilChr08G004606`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=30.8; qcov=0.759; evalue=2.89e-68; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=32.4; qcov=0.527; evalue=1.57e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057780129.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780129.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780129.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780129.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780129.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55629954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B26,B48,C22,C40
`Chr8:55629986`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A21,B44,B48,B55,C51,C69,D11
`Chr8:55630070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B91
`Chr8:55630075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B78
`Chr8:55630084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B107,B110
`Chr8:55630121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,B85
`Chr8:55630134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B13
`Chr8:55630134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:55630140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B117,B54,C57
`Chr8:55630211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:55630246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:55630257`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A11,B117,B54,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780129.1

895 aa

448

895

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 152-317 aa PF23559 WHD_DRP 401-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780129.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	152	317	3.9e-42	144.5	NB-ARC domain
`XP_057780129.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	401	472	2.6e-21	76.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924146.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCATTGATGAACAATATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCCTTTCAACTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAAGCCATTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTGATTACCAACAGTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCATGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCGCACATTATCGATCAAATTCCTGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998737
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCATTGATGAACAATATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCCTTTCAACTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAAGCCATTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTGATTACCAACAGTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCATGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCGCACATTATCGATCAAATTCCTGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780129.1
MAAYAALVSLMNNIEQMMSHPRLSTVFDKKQIEAIGEKADGLLDLITNSNIDGGSKEASDLESQIASAAHAAEDVIESHIIDQIPAGSSHGCSLLDLQQIIEDMDGIMRKGAELKEKLRAREEQATHGEMDAVEEKQPLTTTTGKASPVGLEDDVIHIMDKLTIHQPKQQIISIVGMGGMGKTTLALNVYENSFIKEHFDIRAWATVSQQYCAKEIFSKLLSSIAQSGSENDLGLELHQSLWGRRYLIVLDDIWSVEAWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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