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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004621`

染色体: Chr08 坐标: 55757625-55761382 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004621`
名称	SmilChr08G004621
描述	uncharacterized SmilChr08G004621
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55757625 - 55761382 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999386`
GeneID	`130999386`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130999386`
原始查询	`SmilChr08G004621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818365]; symbol=AT2G37890; hit=AT2G37890; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818365]; symbol=AT2G37890; hit=AT2G37890; species=arabidopsis; confidence=medium
拟南芥	`AT2G37890` (AT2G37890) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818365] identity=64.71; qcov=0.624; evalue=3.61e-23; confidence=medium
水稻	`Os03g0267700` - identity=63.93; qcov=0.56; evalue=7.88e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999386

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	线粒体	0.80000	`SmilChr08G004621.1`
2	线粒体膜	0.40000	`SmilChr08G004621.1`
3	线粒体内膜	0.20000	`SmilChr08G004621.1`
4	内质网	0.20000	`SmilChr08G004621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55761000`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A11,A20,A22,A3,B1,B104,B119,B128,B14,B17,B54,B58,B65,B87,C6,C85,C87,D9
`Chr8:55761021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C76,D6,D8
`Chr8:55761129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B1,B104,B119,B128,B14,B17,B58,B65,C85,C87
`Chr8:55761157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C76,D6,D8
`Chr8:55761164`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A11,A20,A22,A3,B1,B104,B119,B128,B14,B17,B54,B58,B65,B87,C6,C76,C85,C87,D6,D8,D9
`Chr8:55761202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,B80,B84,C7,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004621.1

来源蛋白: XP_057780902.1

109 aa

109

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 41-102 aa

SmilChr08G004621.2

来源蛋白: XP_057780903.1

109 aa

109

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 41-102 aa

SmilChr08G004621.3

来源蛋白: XP_057780904.1

109 aa

109

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 41-102 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004621.1` XP_057780902.1	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	41	102	1.6e-08	34.9	Mitochondrial carrier protein
`SmilChr08G004621.2` XP_057780903.1	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	41	102	1.6e-08	34.9	Mitochondrial carrier protein
`SmilChr08G004621.3` XP_057780904.1	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	41	102	1.6e-08	34.9	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093487.1
CAATTTAACGGTAAAATTTTAGCGCCAGATTTTATCTCTCCCACGTTCTTTCAAACTAATATTAACCACGATTGAATTCTTCTCCACGATTCTGAAACCCTTTTCATCCACTCTCTTTCTCTTCCAAATTCTATAACCACTCTTCGTCGATCCATCGCTCACCAAACTCAATTGAAGATTCGGCCGCCATTTCTCGGTCGTCAACTGCCGCCCTAGCGCCGCCGCCTCAGACCAACGTCTCCCAAACGATTCCATAACCT...

XR_009093488.1
AATTTAACGGTAAAATTTTAGCGCCAGATTTTATCTCTCCCACGTTCTTTCAAACTAATATTAACCACGATTGAATTCTTCTCCACGATTCTGAAACCCTTTTCATCCACTCTCTTTCTCTTCCAAATTCTATAACCACTCTTCGTCGATCCATCGCTCACCAAACTCAATTGAAGATTCGGCCGCCATTTCTCGGTCGTCAACTGCCGCCCTAGCGCCGCCGCCTCAGACCAACGTCTCCCAAACGATTCCATAACCTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004621.1 (XP_057780902.1)
ATGCTAACAGGTGGAGAAAAGTATCAGATCAAAGGGTGTGCAGGTGAGGATGGGTTTTCTCAGGTGTTCAAAGACTATGTGAACAACAATCCTAATGATGTTATTGCCCTTAAGTGGCATATCCCCCCGGATCTTGTGAGGCGTAGAATGCAGTTGGAAGGAGCTGGTGGTAGAGCTCGTGTTTACAGAAAGGGTCTGGTGTGGACTCTGAGGCACATATTCATGAAGGAAGGTTGGCTTGCCCTGTATTGGGGGATTCT...

SmilChr08G004621.2 (XP_057780903.1)
ATGCTAACAGGTGGAGAAAAGTATCAGATCAAAGGGTGTGCAGGTGAGGATGGGTTTTCTCAGGTGTTCAAAGACTATGTGAACAACAATCCTAATGATGTTATTGCCCTTAAGTGGCATATCCCCCCGGATCTTGTGAGGCGTAGAATGCAGTTGGAAGGAGCTGGTGGTAGAGCTCGTGTTTACAGAAAGGGTCTGGTGTGGACTCTGAGGCACATATTCATGAAGGAAGGTTGGCTTGCCCTGTATTGGGGGATTCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004621.1 (XP_057780902.1)
MLTGGEKYQIKGCAGEDGFSQVFKDYVNNNPNDVIALKWHIPPDLVRRRMQLEGAGGRARVYRKGLVWTLRHIFMKEGWLALYWGILPEYYKVGPDAGIIFVPSLYDLL

SmilChr08G004621.2 (XP_057780903.1)
MLTGGEKYQIKGCAGEDGFSQVFKDYVNNNPNDVIALKWHIPPDLVRRRMQLEGAGGRARVYRKGLVWTLRHIFMKEGWLALYWGILPEYYKVGPDAGIIFVPSLYDLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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