当前解析结果
SmilChr08G004623| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004623 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004623 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004623 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 55764985 - 55767640 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130999374 |
|---|---|
| GeneID | 130999374 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999374 |
| 原始查询 | SmilChr08G004623 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0597300- identity=45.3; qcov=0.249; evalue=2.1e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999374 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780889.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780889.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780889.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780889.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057780889.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:55766216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B68,C82 |
Chr8:55766224 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr8:55766762 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr8:55766789 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr8:55766803 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B29,B54,B86 |
Chr8:55766812 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr8:55766817 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,C6 |
Chr8:55766818 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B106,B2,B8,C78 |
Chr8:55766878 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B75,B84,B93 |
Chr8:55766916 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B29,B84 |
Chr8:55766919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr8:55766927 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B47,B7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。