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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004627`

染色体: Chr08 坐标: 55811319-55811744 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004627`
名称	SmilChr08G004627
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55811319 - 55811744 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998751`
GeneID	`130998751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998751`
原始查询	`SmilChr08G004627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=41.9; qcov=0.915; evalue=7.26e-25; confidence=medium
Rice	`Os07g0186500` - identity=40.9; qcov=0.972; evalue=4.55e-24; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057780143.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780143.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780143.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780143.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780143.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55811338`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A1,A10,A15,A20,A3,A4,A7,B12,B126,B134,B137,B19,B21,B25,B26,B31,B5,B55,B56,B63,B66,B67,B8,B90,B92,B94,B97,C11,C13,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C36,C37,C50,C52,C57,C59,C62,C75,D5,D9
`Chr8:55811407`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A13,B10,B104,B12,B122,B125,B2,B23,B44,B7,C22,C27,C40,C55,C81
`Chr8:55811476`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B39,C55
`Chr8:55811476`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B39,C55
`Chr8:55811477`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B39,C55
`Chr8:55811477`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B39,C55
`Chr8:55811563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,C19,C38,C80
`Chr8:55811575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A7,A8,B107,B110,B137,B138,B139,B70,B86,C53,C83
`Chr8:55811673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:55811725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780143.1

141 aa

141

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 8-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780143.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	8	135	3.9e-32	111.9	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924160.1
ATGGTGGGATTTGGTGGCTGCTTGGATCAGCTCTTGGATTTGCTCACCGGAAATCAATCTAGCCGCCAGATCATCTCAATCGTTGGTATGGGCGGTATTGGTAAGACTACTCTGGCCAAGAATACTTTTGAAAATTCAATTATTAAGCGACAATTTGATGTCCGTGTTTGGGTGTCTGTTTCAAATGATTACAATTTGTCAGATATTTTCTTAGAAGCTCTTTCTCACCTAAAAGAACTCACTAGCACTATTGAGATGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998751
ATGGTGGGATTTGGTGGCTGCTTGGATCAGCTCTTGGATTTGCTCACCGGAAATCAATCTAGCCGCCAGATCATCTCAATCGTTGGTATGGGCGGTATTGGTAAGACTACTCTGGCCAAGAATACTTTTGAAAATTCAATTATTAAGCGACAATTTGATGTCCGTGTTTGGGTGTCTGTTTCAAATGATTACAATTTGTCAGATATTTTCTTAGAAGCTCTTTCTCACCTAAAAGAACTCACTAGCACTATTGAGATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780143.1
MVGFGGCLDQLLDLLTGNQSSRQIISIVGMGGIGKTTLAKNTFENSIIKRQFDVRVWVSVSNDYNLSDIFLEALSHLKELTSTIEMDNERDEYRLGEPLYKGLTGRRYLIVLDDVWSVEVWDKIRFYFPDNGNRSSPHFHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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