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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004638`

染色体: Chr08 坐标: 55914870-55916147 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004638`
名称	SmilChr08G004638
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55914870 - 55916147 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998757`
GeneID	`130998757`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998757`
原始查询	`SmilChr08G004638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G10920` (LOV1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837635] identity=33.7; qcov=1.04; evalue=1.1e-68; confidence=low
Rice	`Os06g0158300` (KMK0024M20.32) - identity=35.3; qcov=1.07; evalue=3.29e-71; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998757

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057780148.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780148.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780148.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780148.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55914899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B52
`Chr8:55914954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C1
`Chr8:55914955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B43
`Chr8:55914958`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B64
`Chr8:55914958`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B64
`Chr8:55915016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B56,C49,C63
`Chr8:55915021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C41
`Chr8:55915080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:55915148`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B33,B37,B93,D8
`Chr8:55915148`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B33,B37,B93,D8
`Chr8:55915168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,A6,B77
`Chr8:55915176`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B24,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780148.1

425 aa

212

425

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 4-161 aa PF23559 WHD_DRP 245-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780148.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	4	161	3.8e-38	131.5	NB-ARC domain
`XP_057780148.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	245	315	1.1e-21	77.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924165.1
ATGCAGAGCAAGCTGGAGATCCTGCCCATCATGGGTATGGGTGGTATAGGTAAAACCACTCTTGCTCGAAAACTTTATCAAGATCCACTCATTCTTCACCACTTTAGCTATCTTGCTTCGACCACAATTTCACAAGATTACAATATGAGGTCAATTCTATTAAGCCTTATTCAGTGCATAATTGGAAAAGAAGAATGTGACAAACATAATGGAAAGGGAGATGGTGAGTTAAAAGATATCTTGTATAGGAGCTTGTGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998757
ATGCAGAGCAAGCTGGAGATCCTGCCCATCATGGGTATGGGTGGTATAGGTAAAACCACTCTTGCTCGAAAACTTTATCAAGATCCACTCATTCTTCACCACTTTAGCTATCTTGCTTCGACCACAATTTCACAAGATTACAATATGAGGTCAATTCTATTAAGCCTTATTCAGTGCATAATTGGAAAAGAAGAATGTGACAAACATAATGGAAAGGGAGATGGTGAGTTAAAAGATATCTTGTATAGGAGCTTGTGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780148.1
MQSKLEILPIMGMGGIGKTTLARKLYQDPLILHHFSYLASTTISQDYNMRSILLSLIQCIIGKEECDKHNGKGDGELKDILYRSLCGRRYMIVLDDIWSTTFWDEIRRYFPDNNKGSRIVITTRESDVAKHADSKSLHHKVQLLSESQSWDLLSQIVFGEEDWPHELQGIGKKISSDCGGLPLAINVIGGLLSKVERLKDVWEDIGNDVRAAIAEWDEQFLNILSLSYNHLPLHLKPCFLYMAAFPEDYEIDPLRLIWKW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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