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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004643`

染色体: Chr08 坐标: 55939898-55942433 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004643`
名称	SmilChr08G004643
描述	uncharacterized SmilChr08G004643
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55939898 - 55942433 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999317`
GeneID	`130999317`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999317`
原始查询	`SmilChr08G004643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0629550; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0629550; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G07040` (RPM1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819889] identity=28.5; qcov=0.38; evalue=1.04e-19; confidence=low
Rice	`Os11g0629550` - identity=29.8; qcov=0.398; evalue=1.34e-23; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999317

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057780816.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057780816.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780816.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780816.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780816.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55939910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:55939932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B91,D11
`Chr8:55939933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C14
`Chr8:55939941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:55939958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:55939986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B135,B98
`Chr8:55940061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B135,B98
`Chr8:55940178`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B78
`Chr8:55940178`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B78
`Chr8:55940212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B135,B98
`Chr8:55940240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C82
`Chr8:55940253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780816.1

684 aa

342

684

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 121-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780816.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	121	282	1.5e-30	106.8	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924833.1
CGGGAGCCTGGTGTTGGTGACGACCAGCGCCGTCGACGTCAGTAACCATCCGTCGCTGCGTCTAACTAGTACTAACTTGGAAGATCGGGGCTTACAATATGAGGACATGTGGTGGGGTCTTCTCCGGTGTATGCTGTCGGGGCCCATCTCGCCGGAGTTGGAGGAAGTGGGAAGGAAGGCTGTCCGGAACTGTGGAGGCCGCTTTTTTTGCTTTGTGAAGCTTATCTTCTTCTTATGGAACACCGACTGGAGCGTGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999317
ATGTGGTGGGGTCTTCTCCGGTGTATGCTGTCGGGGCCCATCTCGCCGGAGTTGGAGGAAGTGGGAAGGAAGGCTGTCCGGAACTGTGGAGGCCGCTTTTTTTGCTTTGTGAAGCTTATCTTCTTCTTATGGAACACCGACTGGAGCGTGGAGGCGTGGAGCCAGATAGCCCATCATCCACACCATCCAATCTTCCACCAAATTGTTGATGAACTATCAGAGGTACGTAAAATCAAAGAAGACCTGAACAATTTTACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780816.1
MWWGLLRCMLSGPISPELEEVGRKAVRNCGGRFFCFVKLIFFLWNTDWSVEAWSQIAHHPHHPIFHQIVDELSEVRKIKEDLNNFTDSDKAVLPHFIKDIDAPTGVQFMKEKLFPKRKFFPKMEVISFVGMAGIGKTTFVKKVYEYAKILSQYENIDLRYYKHYVWLTLGPKYKSEDIFIDILAQIFPDIDKMEIKGDAKRVGKLIRGLQNKRLLIVLDNVWSEAPLEHLAKSFPNIKGRALVTTRMGKVARSEKIHIVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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