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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004648`

染色体: Chr08 坐标: 55985898-55989687 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004648`
名称	SmilChr08G004648
描述	TORTIFOLIA1-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55985898 - 55989687 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999328`
GeneID	`130999328`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130999328`
原始查询	`SmilChr08G004648`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TORTIFOLIA1-like protein 4
产物	TORTIFOLIA1-like protein 4
拟南芥	`AT1G27210` (AT1G27210) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839610] identity=42.03; qcov=0.946; evalue=7.89e-145; confidence=medium
水稻	`Os02g0739900` - identity=38.6; qcov=0.943; evalue=3.56e-82; confidence=medium
GO	GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	PF24714 (TOR1L1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999328

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`SmilChr08G004648.1`
2	细胞骨架	0.60000	`SmilChr08G004648.1`
3	细胞质基质	0.40000	`SmilChr08G004648.1`
4	成膜体	0.20000	`SmilChr08G004648.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55986554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,B90,B92,C42
`Chr8:55986717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B10,B40,C60,C62
`Chr8:55987171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B137,B18,C54,D2
`Chr8:55987459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B88
`Chr8:55987589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:55987610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr8:55988570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B23
`Chr8:55988681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B74,C69
`Chr8:55988789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C69,C76
`Chr8:55988792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:55988801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C69,C76
`Chr8:55988964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004648.1

来源蛋白: XP_057780826.1

631 aa

316

631

TOR1L1_N

PF24714 TOR1L1_N 14-288 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004648.1` XP_057780826.1	Pfam	`PF24714`	TOR1L1_N	Repeat	14	288	1.8e-109	366.2	TORTIFOLIA1 N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093472.1
GTTATATATAATTCTCAAAGGAGAAATCGGAAAAAAACAGAAAAAGTAAATCTGAGCTCAACTACCTCTCATCTTCTCCGACCACCGCGATGCCGCCGGAGATGCCGCCGGCGCCTCCGCCACCTCTGCAAACTTAAAAATTCTCCACTCATCTCACATTTTCCAGCAGTTTAACGAGAATGTCGGCCTCCAATTCCGCCAAGCAAGCCAAGGCACGTGACATGAAGCAACGCGTGCTCACGTGCCTCCACAAGCTAGCC...

XM_057924843.1
GCTTTCGTTTTGTCACATTTCTATTGCTCATTTCCAAAATTTATGCCTTAGTTTTAAATCAAATCCAACCCCTATTTTTTATTTTTCTTCCAAAGAAAGAAAAGATGATACGTGTACTCACCAAAACGGCACCGTTGGCCGCAGTTATTTATTTCTAGTTATAAATACCAAGAGAAAAATACCATACTGCCCCGCACCGTTATATATAATTCTCAAAGGAGAAATCGGAAAAAAACAGAAAAAGTAAATCTGAGCTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004648.1 (XP_057780826.1)
ATGTCGGCCTCCAATTCCGCCAAGCAAGCCAAGGCACGTGACATGAAGCAACGCGTGCTCACGTGCCTCCACAAGCTAGCCGACAGGGACACGCACTCCGCCGCCGCGTCGGAGCTCGAATCCATCGCCAGGACGCTCCCCGCCGACGCGCTCCCCTCCTTCATCTCCTCAGTCGCCGCCACCGACGCCTCCGACAAGTCACCCGTCCGCCGCCAGTGCCTCCGGCTGGTCTCGATCCTCTCCGAGCACCACGGGAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004648.1 (XP_057780826.1)
MSASNSAKQAKARDMKQRVLTCLHKLADRDTHSAAASELESIARTLPADALPSFISSVAATDASDKSPVRRQCLRLVSILSEHHGNSLSPYLSKILSAVVRRLRDADSSVRSACVAASLSLSSHVTSPPFASVIKPFVESLFTEQETNAQTGAALCLAAAIEGSRNPDAASLRRLLPRIEKLAKSESFKAKPALLALVGSLVAVDGVLRGGGRNVVWNLLNLLVDFLSSDDWAARKAAAEALVKIAAVESESLSEYKASC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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