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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004649`

染色体: Chr08 坐标: 56002154-56003245 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004649`
名称	SmilChr08G004649
描述	uncharacterized SmilChr08G004649
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56002154 - 56003245 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998760`
GeneID	`130998760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998760`
原始查询	`SmilChr08G004649`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0156200` - identity=37.3; qcov=0.281; evalue=2.13e-07; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780150.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780150.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780150.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780150.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56002159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B80
`Chr8:56002159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:56002165`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B59
`Chr8:56002165`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B59
`Chr8:56002191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C86
`Chr8:56002222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B7,C42,C60
`Chr8:56002228`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B107,B125,B13,B7,B80,C48,C65
`Chr8:56002257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr8:56002288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:56002309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:56002348`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	84	A18,A19,A24,A4,A8,B105,B106,B114,B118,B119,B12,B123,B129,B130,B133,B134,B135,B136,B138,B14,B16,B18,B2,B20,B25,B33,B35,B36,B4,B40,B41,B46,B47,B5,B51,B52,B60,B62,B63,B64,B67,B72,B81,B85,B87,B89,B9,B90,B92,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C16,C19,C20,C21,C29,C33,C38,C39,C42,C46,C49,C51,C52,C53,C54,C56,C65,C69,C70,C72,C73,C76,C80,C83,C84,C9,D6,D8,D9
`Chr8:56002360`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A8,B105,B106,B114,B118,B119,B12,B123,B133,B134,B135,B138,B14,B16,B25,B33,B36,B41,B46,B5,B60,B62,B64,B67,B85,B87,B9,B92,B98,C10,C11,C12,C19,C20,C21,C33,C38,C39,C46,C49,C51,C52,C53,C54,C56,C65,C69,C73,C76,C80,C83,C84,C9,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780150.1

363 aa

182

363

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 22-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780150.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	22	69	1.4e-10	41.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924167.1
ATGGTGGAAGAGCTGGATTCTGAAAATAATTTTGCTGGATGCTTCGCCAGGTTTAAAGTAAATTTTGATGTTACGGTTCCCCTATTGAGAGGGATCACGATAGCTTTTGAGGGCAAGCAGCTGTGGGTTCCTCTTAAATATGAAAACTTGCCGATCTTTTGCTATCGATGTGGATTGATGGGTCATCATATCAGAGCTTGTGATAAAGAACGGGATGAAGATGAAAATGGGCGTCATTTTGAAGACCTCCTCTATGGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998760
ATGGTGGAAGAGCTGGATTCTGAAAATAATTTTGCTGGATGCTTCGCCAGGTTTAAAGTAAATTTTGATGTTACGGTTCCCCTATTGAGAGGGATCACGATAGCTTTTGAGGGCAAGCAGCTGTGGGTTCCTCTTAAATATGAAAACTTGCCGATCTTTTGCTATCGATGTGGATTGATGGGTCATCATATCAGAGCTTGTGATAAAGAACGGGATGAAGATGAAAATGGGCGTCATTTTGAAGACCTCCTCTATGGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780150.1
MVEELDSENNFAGCFARFKVNFDVTVPLLRGITIAFEGKQLWVPLKYENLPIFCYRCGLMGHHIRACDKERDEDENGRHFEDLLYGPILKASPLKRLRTPRQATSPPRKFNPPNAKHPTSNLPTKTQTIILSHNNARKPRPPPLSFNPIIEPKPKYPCFTPDDSNLSPAKDSHNLKLKSFDSISNTNLKTTTVTQKSSQPSASYDTTNPNITPIADIMEFLKIQPTSTSIPPISTPTPMPNPVTMQAPFNPAKNPTDPVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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